Una comparación entre la frecuencia funcional y los flujos metabólicos enmarcados por ciclos biogeoquímicos en metagenomas: el caso de las aguas termales de "El Coquito" ubicadas en el parque nacional de Nevados en Colombia
Realizamos una reconstrucción metabólica en una fuente termal ácida ubicada en PNN y realizamos un análisis de balance de flujo del conjunto de reacciones relacionadas con el metabolismo.
PNN nevados |
El estudio de muestras metagenómicas es crucial para comprender las comunidades microbianas en los ecosistemas. En este estudio, se analizaron muestras genómicas de las aguas termales ácidas "El Coquito", ubicadas en el Parque Nacional Natural Nevados en Colombia, para evaluar la relación entre su funcionalidad metabólica y la distribución de flujos metabólicos considerando las restricciones termodinámicas y los ciclos biogeoquímicos. Un análisis de balance de flujo.
La funcionalidad metabólica del metagenoma se estableció al asignar reacciones y enzimas a las rutas metabólicas. Por un lado, encontramos que los grupos metabólicos relevantes contribuyen de una manera diferente según la función objetivo del ecosistema desde la perspectiva de la cantidad de reacciones metabólicas. Por otro lado, desde la contribución hasta el punto de vista del flujo metabólico total, parece que se conserva la plasticidad de la distribución metabólica, ya que existen varios grupos comunes que contribuyen significativamente al flujo metabólico total del sistema. Sin embargo, esta plasticidad no se mantiene para todas las funciones objetivas debido a las diferencias entre el nitrógeno y el resto de los ciclos, lo que demuestra claramente que la capacidad de adaptación microbiana al ecosistema se materializa en la distribución de los flujos metabólicos en lugar de la frecuencia de aparición. De las mismas reacciones.
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