Diseño in silico y evaluación de acoplamiento molecular de péptidos derivados de bacteriocinas y defensina-2 porcina como inhibidores de la proteína de la cápside del virus de la hepatitis E
El virus de la hepatitis E (HEV) se considera el principal agente etiológico que causa la hepatitis aguda. Se estima que 20 millones de casos ocurren anualmente en todo el mundo, alcanzando tasas de mortalidad del 28% en mujeres embarazadas.
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| Acoplamiento molecular |
El virus de la hepatitis E (HEV) se considera la causa más común de hepatitis aguda e ictericia, especialmente en los países en desarrollo, mientras que en los países desarrollados, las infecciones por HEV se consideran una zoonosis emergente. El HEV es un virus de ARN de una sola hebra no envuelto de la familia Hepeviridae y se clasifica en cuatro genotipos (genotipo 1-4), y aunque se sabe que puede infectar una amplia gama de hospedadores de vertebrados, el cerdo doméstico se considera el reservorio principal; en Colombia, la sangre y las heces de los mataderos de cerdos fueron 100% positivas para IgG, y un 25% de los hígados de cerdo vendidos en tiendas de comestibles fueron positivos para HEV.
Se piensa que el consumo de agua contaminada con virus, productos animales y manipulación de animales infectados es la forma en que los trabajadores agrícolas se convierten en la población más susceptible, alcanzando un 15.7% de anticuerpos anti-HEV en algunas regiones de Colombia. Se estima que un tercio de la población mundial está infectada con el HEV y la tasa de mortalidad es del 1%, pero el riesgo aumenta en mujeres embarazadas y en pacientes inmunocomprometidos, en los que la infección puede alcanzar hasta el 28 y el 10%, respectivamente.
La estructura de la proteína de la cápside del VHE se seleccionó en función de su importancia para la entrada del virus a la célula huésped y se recuperó del Banco de Datos de Proteínas (ID de PDB: 3RKC), teniendo en cuenta que esta estructura tiene la resolución más alta (1.79 Å) Entre todas las proteínas reportadas de este virus. La estructura se preparó con herramientas PMV-1.5.6 que eliminan las moléculas de agua del sistema, agregando solo hidrógenos polares y calculando las cargas de Gasteiger para minimizar la energía. La estructura minimizada se guardó como un archivo PDBQT para los experimentos de acoplamiento.
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