Secuencias genómicas no contiguas terminadas y descripciones de Actinomyces ihuae, Actinomyces bouchesdurhonensis, Actinomyces urinae, Actinomyces marseillensis, Actinomyces mediterranea y Actinomyces oralis sp. nov. Identificado por la culturomica.
El enfoque taxonogenómico, incluidas las técnicas de cultivo, se utiliza actualmente para aislar y caracterizar nuevas bacterias. Estos enfoques nos permitieron, en particular, descubrir seis nuevas especies del género Actinomyces: Actinomyces ihuae, cepa SD1, Actinomyces bouchesdurhonensis, cepa Marseille-P2825, Actinomyces urinae, cepa Marseille-P2225, Actinomyces marseillensis, cepa Marseille-P2818, Actinomyces mediterranea.
Las colonias son de color gris brillante, con un diámetro de 1 a 2 mm. El crecimiento óptimo ocurre a 37 ° C en una atmósfera aeróbica en agar preparado en Colombia enriquecido con un 5% de sangre de oveja después de 24 horas de crecimiento. La cepa SD1 fue susceptible a gentamicina, amoxicilina / ácido clavulánico , clindamicina, imipenem, rifampicina, amoxicilina , doxiciclina y vancomicina. El principal ácido graso es el ácido hexadecanoico. El genoma de la cepa tiene 2 458 350 pb de largo con un 58.89% de contenido. El 16S RNA gen y las secuencias del genoma están disponibles en la base de datos del Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL) -EBI (Instituto Europeo de Bioinformática) con los números de acceso LN866997 y CZPX00000000, respectivamente.
Las células son bacilos grampositivos con una longitud de 1.5 a 1.9 μm y una anchura de 0.5 a 0.6 μm. Esta cepa no exhibió actividad catalasa y oxidasa. Actinomyces bouchesdurhonensis no es móvil y no forma esporas. Las colonias son lisas y grises con un diámetro de 0,6 a 1,5 mm. El crecimiento óptimo ocurre a 37 ° C en una atmósfera anaeróbica en un agar preparado en Colombia enriquecido con 5% de sangre de oveja después de 24 horas de crecimiento.
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