48/5000 Nuevos enfoques en la sistemática de las rickettsias
El desarrollo de un análisis de orden formal (FOA) permitió construir una clasificación de 49 genomas de representantes de la familia Rickettsiaceae. Recientemente, la FOA se ha ampliado con nuevas herramientas: "Mapa de genes", "Matriz de similitud" y "hashing sensible a la localidad", para un estudio más profundo de la estructura de los genomas rickettsiales.
El análisis del gen 23S RNA permitió discriminar las cepas de R. rickettsii en tres grupos: (a) Brasil y Colombia, (b) Hlp 2 (c) todas las cepas restantes. Dos cepas de R. canadensis exhibieron una homología completa entre sí solo para el gen 5S RNA y también fueron 100% homólogas con R. bellii, R. rhipicephali, R. montanensis, R. monacensis, R. felis y R. japonica. Dos cepas de R. amblyommatis exhibieron una homología absoluta del 100% para el ARN 5S.
La herramienta MS se utilizó para el análisis intraespecífico en profundidad de las especies de Rickettsia más patógenas, R. prowazekii (diez cepas) y R. rickettsii (11 cepas). Se estudió la correlación entre la puntuación de MS (característica genotípica) obtenida mediante el análisis de sus genomas con FOA y virulencia. La herramienta MS determina el grado de homología de los genomas completos mediante una comparación por pares de sus componentes y la identificación de componentes idénticos y similares en la disposición de los nucleótidos. Los resultados se presentan en este articulo, respectivamente. Las cepas se clasificaron dentro de estas especies de acuerdo con la disminución de la puntuación de la EM con R. prowazekii str. Breinl y R. rickettsii str. Sheila Smith, que son cepas tipo que tienen un alto grado de virulencia bien caracterizado.
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