Mitogenomas completos de antiguos cobayos del Caribe (Cavia porcellus)
La cobaya doméstica (Cavia porcellus) fue trasladada desde Sudamérica a varias islas del Caribe en algún momento después del 500 Era Comun. La identificación del momento y las rutas de la translocación de conejillo de indias puede proporcionar un proxy para la interacción humana en la región. Una investigación reciente del ADN de restos de cobayas del Caribe, basada en secuencias de regiones cortas del bucle D mitocondrial y citocromo B, sugirió un origen colombiano y una introducción única de conejillos de indias en el Caribe.
Sobre la base de las comparaciones entre los datos de ADN y los datos modernos de Cyt B, Kimura et al. argumentaron que las muestras arqueológicas del Caribe pertenecían a las especies domésticas y que las muestras del Caribe estaban más estrechamente relacionadas con las muestras colombianas modernas. A partir de estos resultados, y la baja variación observada en las muestras antiguas, Kimura et al. concluyó que los conejillos de indias caribeños antiguos probablemente se derivaban de una sola fuente de población en Colombia. Además, los autores sugirieron que las muestras europeas modernas podrían haber sido derivadas de la población del Caribe.
Con el fin de seguir investigando los resultados y conclusiones, y determinar si más datos de muestras antiguas podrían proporcionar información adicional sobre la historia de translocación de conejillos de indias caribeños y esferas de interacción humana antiguas en la región, realizamos análisis de secuencias mitogenomas completas para identificar la variación genética presente en la guinea caribeña antigua cerdos Los restos arqueológicos de ocho cobayas de cinco islas del Caribe se procesaron utilizando hibridación en solución y tecnología NGS. Nuestro objetivo fue determinar si los mitogenomas completos proporcionarían una mayor resolución para analizar la variación dentro de las antiguas poblaciones de cobayas domésticas en el Caribe, y determinar si existe un nivel adecuado de variación en las secuencias antiguas para justificar su uso como un modelo comensal para evaluar humanos.
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