Colombia, una diversidad genética desconocida en la era de la Big Data
América Latina alberga algunos de los países con mayor biodiversidad en el mundo, incluida Colombia. A pesar del uso creciente de tecnologías de vanguardia en varios estudios biológicos de genómica y bioinformática. En los campos de la ciencia en todo el mundo, la región se ha retrasado en la inclusión de estos enfoques en los estudios de biodiversidad. En este estudio, utilizamos métodos de minería de datos para buscar en cuatro bases de datos públicas principales de secuencias genéticas tales como: NCBI Nucleotide and BioProject, Pathosystems Resource Integration Center y Barcode of Life Data.
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| Biodiversidad en Colombia |
Colombia es uno de los principales países que albergan la mayor diversidad a nivel mundial, debido a la alta riqueza de especies para diversos grupos taxonómicos. Esta categoria es compartida con otros países megadiversos, como Brasil, Bolivia, China, Costa Rica, Ecuador, India, Indonesia, México, Perú, Sudáfrica y Venezuela. Actualmente, hay aproximadamente 56,343 especies reportadas para Colombia, incluyendo 7385 vertebrados, 20,647 invertebrados, 1637 líquenes, 2160 algas, 30,736 plantas, y 1637 hongos. Estos números sitúan a Colombia como El segundo país más megadiverso del mundo sin tener en cuenta la riqueza de especies microbianas. Además, ocupa el primer lugar en biodiversidad de aves y orquídeas; Segundo en plantas, anfibios, mariposas y pescado de agua dulce; tercero en palmas y reptiles; y sexto en mamíferos.
En América Latina, la generación de información de secuencias de ADN y la bioinformática han avanzado lentamente en comparación con otras regiones del mundo. Este es un tema relevante, dado que la biología molecular ha alcanzado la era de Big Data, a través del desarrollo continuo de tecnologías de secuenciación de alto rendimiento que facilitan la generación masiva de datos genéticos, lo que lleva a una disponibilidad generalizada de datos de secuencias en bases de datos públicas. Sin embargo, la disponibilidad de datos genéticos públicos de los países de América Latina es incierta y se sabe poco sobre la cantidad de datos de biodiversidad molecular que se encuentran en las bases de datos públicas.
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