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Bases de datos biológicas


Las bases de datos más relevantes en biología incluyen datos de secuencias de nucleótidos, proteínas, estructura de proteínas, genomas, expresión genética, bibliografía, taxonomía, metabolismo, factores de transcripción, etc. Nos podemos hacer una idea de las bases de datos disponibles en esta base de datos de bases de datos biológicas.





Bases de datos de secuencias

Una base de datos de nucleótidos es una colección de secuencias de ADN o proteínas.
A estas secuencias normalmente se les añade alguna información relevante y una interfaz para poder acceder a la propia base de datos.

Las tres bases de datos principales de nucleótidos son: EMBL , Genbank y DDBJ.
Intercambian las nuevas secuencias todos los días, por lo tanto, en las tres se encuentra depositada la misma información.

Con el tiempo estas bases de datos han ido añadiendo información adicional a las secuencias y ahora incluyen funciones, mutaciones, proteínas codificadas, referencias bibliográficas, etc.

El crecimiento anual de estas bases de datos es enorme. En el recuento del 15 de Junio de 2007 había más de 73 millones de secuencias en la Genbank y en 2012 mas de 157 millones, y este crecimiento exponencial dista mucho de saturarse.


_images/716px-Growth_of_Genbank.svg.png

Dado el gran número de secuencias incluidas las bases de datos suelen estar divididas en secciones para facilitar la búsqueda.

Principales bases de datos

Bases de datos se secuencias de nucleótidos:
Algunas bases de datos de genomas de organismos concretos:
Principales bases de datos de proteínas:
Bibliografía:
Rutas metabólicas:
Enfermedades genéticas humanas:

Fuente:




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