Una nueva herramienta bioinformática para identificar el origen de ciertas enfermedades
Esta novedosa herramienta permite rastrear los patrones de variación genética, a la vez que facilita la sistematización e interpretación de los datos en términos farmacogenómicos.
El Dr Allan Orozco Solano |
Para entender las
enfermedades genéticas complejas, es necesario disponer de una lista completa
de los genes participantes y luego estudiar sus interacciones y variaciones, lo
cual representa una inmensa cantidad de datos.
Esta novedosa herramienta
permite rastrear los patrones de variación genética, a la vez que facilita la
sistematización e interpretación de los datos en términos farmacogenómicos.
Es por eso que la revista
Bioinformatics de la Universidad de Oxford de Inglaterra, decidió publicar el artículo
científico elaborado por los investigadores ticos participantes en el proyecto,
bajo el título: “Portal de visualización de variaciones genéticas (VizGVar):
Una herramienta para la visualización de interacciones de SNPs y mutaciones
somáticas en exones, genes y dominio de proteínas”.
Esa es la primera ocasión en
que esta Revista, considerada la más importantes en el mundo en bioinformática,
publica un artículo científico producto de una investigación costarricense.Esto se debe a que, con esta
primera herramienta bioinformática desarrollada en Costa Rica. Con ella los
científicos costarricenses han demostrado la capacidad del país para
desarrollar tecnologías en bioinformática.
Este sistema bioinformático
fue creado por los ingenieros en diseño del Instituto Tecnológico de Costa Rica
Verónica Alfaro Arias y Antonio Solano Román, en conjunto con el especialista
de Internet de Cenfotec, Carlos Cruz.
Por parte de la UCR
participó como asesor y guía del proyecto el Dr. Allan Orozco Solano,
investigador y profesor del Posgrado en Ciencias Biomédicas y de la Escuela de Tecnologías
en Salud de la UCR.Sobre esta importante
publicación el Dr. Orozco explicó que “abre un espacio por primera vez para que
otros desarrollen aplicaciones de esta clase”.
Recordó que en el 2013 la
revista Briefings in Bioinformatics, también de la Universidad de Oxford,
publicó por primera vez un artículo costarricense “Un repaso del entrenamiento
en bioinformática aplicado a la investigación en medicina molecular,
agricultura, y biodiversidad en Costa Rica y Centroamérica”, escrito en
conjunto con los estudiantes de la Maestría en Bioinformática de la UCR.
Sobre el impacto que ha
tenido la herramienta, el Dr. Orozco señaló que “actualmente, el Laboratorio
Europeo de Biología Molecular (EMB por sus siglas de European Molecular Biology
Laboratory) con sede en Inglaterra, considera esta herramienta constarricense,
web VizGVar, como un instrumento bioinformático de gran utilidad y así lo
manifestó oficialmente en su reporte de valor europeo del 2016, donde se
refiere a él como una de las herramientas de mejoramiento a los sistemas
actuales de variantes.
Debido a este y otros
aportes en bioinformática y genómica a nivel internacional, el Dr. Allan Orozco
fue reconocido como uno de los “universitarios destacados” en 2016 por el
Consejo Universitario de la UCR, donde se le concedió el Premio Cátedra
Genómica 2014-2015, categoría internacional, por el mejor proyecto de
investigación, otorgado por la Facultad de Medicina de la Universidad de
Valencia, España. (Fuente: UCR/DICYT).
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