Datos del primer ensamblaje transcripto de una especie no modeloada,La tortuga carey, anidación del Caribe colombiano
La tortuga carey, Eretmochelys imbricata, es una especie en peligro de extinción en la costa colombiana del Caribe debido a factores antrópicos y naturales que han disminuido sus niveles de población. Poco se sabe acerca de los genes que están involucrados en su sistema inmunológico, la determinación del sexo, el envejecimiento y otras funciones importantes.
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| Tortuga carey |
La tortuga carey, Eretmochelys imbricata, es una especie no modelo que se encuentra en todos los trópicos en las regiones del Atlántico central e Indo-Pacífico. informaron que esta especie anida desde el estado de Florida (EE. UU.) En el Caribe, hasta la costa sur de Espírito Santo en Brasil. se localizó áreas de alimentación para la tortuga carey en Colombia en las Islas del Rosario y en el Parque Natural Nacional de Cabo de la Vela.
Esta tortuga está clasificada por la Unión para la Conservación de la Naturaleza en peligro crítico y en el Apéndice I de CITES. Las principales causas de la disminución de la población incluyen la comercialización de carnes y conchas, el consumo de huevos y la producción de petróleo, la captura incidental en la pesca industrial y artesanal y la pérdida de hábitat. La demanda de conchas continúa hoy en el mercado negro con la disminución dramática de su población.
La secuenciación de transcriptomas y el procesamiento de lectura se han resumido en este articulo. Obtuvimos un total de 47,586 transcripciones ensambladas con un N50 = 1100 pb, longitud promedio de 724 pb.
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