Investigación sobre leishmaniasis participará en encuentro internacional
Con el fin de presentar y
reconocer el trabajo conjunto entre las redes académicas del país, que
busquen impactar positivamente la investigación científica, la Red
Nacional Académica de Tecnología Avanzada (RENATA) y RUTA Caribe, abrieron una convocatoria para que diferentes entidades presentaran sus desarrollos y avances.
El
Centro de Bioinformática y Biología Computacional de Colombia - BIOS, en
representación de la red académica caldense RADAR y la Universidad de
Antioquia como integrante de la red académica antioqueña RUANA,
presentaron un documento conjunto sobre la simulación y modelamiento de
proteínas de leishmaniasis, el cual fue aceptado para participar en el
Tercer Encuentro Internacional de E-Ciencia en Barranquilla, Atlántico,
del 13 al 14 de mayo de este año.
Gracias al programa 3CoA
(Comunidad Colombiana de Computación Avanzada) de RENATA se hizo el
puente entre PECET, grupo de investigación de la Universidad de
Antioquia y BIOS, lo que ayudó a la transferencia rápida y oportuna de
datos de entrada y salida pertenecientes al flujo de trabajo
bioinformático propuesto, en el cual el PECET se encargaba de la
preparación y análisis de las datos, y el Centro ejecutaba los
respectivos cálculos.
Hasta el momento se han modelado y
validado 18 proteínas. El propósito posterior de este proyecto es
realizar revisiones en distintas librerías virtuales y seleccionar una
lista de potenciales compuestos anti-Leishmania que sean validadas experimentalmente, con el objetivo de aumentar el impacto de este proyecto.
Esta investigación fue realizada por Rodrigo Ochoa, Diego Guerra y Carlos Muskus, de PECET , Juan Carlos Correa y Diego Ceballos de BIOS.
Para Ceballos “la Universidad de
Antioquia necesitaba simular la modelación de estas proteínas y
necesitaban infraestructura computacional, luego de realizar esta
investigación, supimos de la convocatoria de RENATA y decidimos
participar y construir el documento y el póster. Recibimos la buena
noticia que fuimos aceptados”.
Esta investigación se realizó sobre el clúster Linux de BIOS.
Según Juan Carlos Correa, en el
documento se explica cómo fue el proceso de la investigación, “en
general se utilizaron alrededor de 14 a 15 cores por
simulación, con un promedio de memoria RAM de 10 GB. El tiempo promedio
de cálculo fue de 19.62 horas, teniendo en cuenta que se procesaron dos
modelados simultáneamente”.
PECET y BIOS presentarán dicho avance en un póster en este evento, uno de los premios es participar en las charlas y talleres.
El trabajo conjunto entre RADAR y
RUANA, una importante muestra de que al unir las capacidades entre
diferentes entidades, se pueden sacar adelante grandes investigaciones.
