Estimación de parámetros genéticos para características productivas y reproductivas en los sistemas doble propósito del trópico bajo colombiano

RESUMEN

Con el objetivo de estimar los componentes de varianza, las heredabilidades, repetibilidades y correlaciones genéticas y fenotípicas para la producción de leche por lactancia (PL), el peso al destete (PD), el intervalo entre partos (IEP) y el Índice de Vaca (IV), de las hembras bovinas manejadas en los sistemas de producción de doble propósito del trópico bajo colombiano, se analizaron los registros productivos y reproductivos de 1.687 vacas registradas en la Asociación Colombiana de Criadores de Ganado en

Doble Propósito (Asodoble), durante el periodo comprendido entre 1998 y 2007. Se empleó un modelo animal mixto que incluyó los efectos fijos del grupo contemporáneo (finca-sexo-época-año), la composición racial, y la duración de la lactancia como covariable; así como los efectos genéticos aleatorios del animal, el medio ambiente permanente y el residual. Las heredabilidades estimadas para IEP (0,04) y PD (0,11) fueron bajas, y moderadas para PL (0,35) e IV (0,24), respectivamente. La repetibilidad estimada para IEP fue baja (0,08), y para PL (0,41) e IV (0,31) moderada; en el caso de PD este valor fue igual a la heredabilidad (0,11). Las correlaciones genéticas y fenotípicas obtenidas entre PL y PD con respecto a IEP fueron positivas, y se determinó una asociación genética negativa entre PL y PD. Los resultados demostraron que el IV es un buen indicador, desde el punto de vista genético, de la eficiencia productiva y

reproductiva de los animales manejados en estos sistemas productivos.

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Enfermedades de Origen Genético en Pacientes Pediátricos Hospitalizados en la Provincia de Ubate, Colombia.

RESUMEN

Objetivo Realizar una descripción de la frecuencia de patologías genéticas en el servicio de hospitalización pediátrica de un hospital de segundo nivel de atención. Métodos Revisión completa de los registros del Departamento de Estadística del hospital en el año 2005. El estudio se realizo en el pueblo de Ubaté durante el año 2006.

Resultados Cerca del 25 % de las hospitalizaciones, se originó en enfermedades complejas, incluyendo enfermedades multifactoriales y malformaciones congénitas, sin embargo, el estudio etiológico y la valoración por el genetista se llevan a cabo en pocas ocasiones.

Conclusiones El hospital de atención primaria debe ser un centro de referencia de mayor relevancia para la detección de patologías de causa genética en la población pediátrica, se requieren nuevos mecanismos para poner en práctica este propósito, con el fin de permitir a los pacientes acceso al genetista y llevar a cabo un diagnóstico etiológico y asesoría genética adecuados.

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Inscripciones abiertas al proceso de admisión a la Maestría en Bioinformática para el primer semestre de 2014. 

TITULO: MAGÍSTER EN BIOINFORMÁTICA

HORARIO: Los cursos ofrecidos por la Maestría se programan entre lunes y viernes, generalmente en dos sesiones de 7:00 a 9:00 a.m. 6:00 a 8:00 p.m.

El plan de estudios de investigación de la Maestría en bioinformática tiene una duración de cuatro (4) semestres.

La Maestría en Bioinformática en la Universidad Nacional de Colombia basada en las capacidades alcanzadas por la Universidad tanto de docencia como investigación en el área de la bioinformática, es un programa de Posgrado Interdisciplinario dirigido a la formación avanzada de profesionales en bioinformática capaces de plantear, analizar y resolver problemas en ciencias de la vida, fortalecer este campo de conocimiento y consolidar una comunidad científica que contribuya al avance del conocimiento biológico.

La Maestría en Bioinformática esta basada en las siguientes líneas de investigación: Biología funcional y estructural, Biología de Sistemas y Tecnologías computacionales en Bioinformática, con el soporte de varios grupos de investigación, de reconocida experiencia en cada una de estas.

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BIOSTEC 2014

El propósito de Biostec es reunir a investigadores y profesionales, incluyendo ingenieros, biólogos, profesionales de la salud y la informática / informáticos, interesados ​​tanto en los avances teóricos y las aplicaciones de los sistemas de información, inteligencia artificial, procesamiento de señales, electrónica y otras herramientas de ingeniería en las áreas de conocimiento relacionados con la biología y la medicina. Biostec se compone de cinco conferencias  co-localizados, cada uno especializado en al menos una de las áreas de conocimiento principales antes mencionados.

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Talleres Internacionales de Bioinformática 2014

 

 

El Nodo Nacional de Bioinformática (NNB-UNAM) y la Sociedad Iberoamericana de Bioinformática (SoIBio), con el apoyo del Centro de Ciencias Genómicas (CCG-UNAM), el Instituto de Biotecnología (IBt-UNAM), la Licenciatura en Ciencias Genómicas (LCG-UNAM), la Facultad de Medicina de la UAEM y EMBnet organizan los "Talleres Internacionales de Bioinformática 2014", que se llevarán a cabo del 13 al 24 de Enero de 2014 en las instalaciones del CCG en Cuernavaca Morelos, México.

Centro de Bioinformática del Instituto de Biotecnología (CBIB).

El Centro de Bioinformática del Instituto de Biotecnología de la Universidad Nacional de Colombia (clasificado por COLCIENCIAS: COL0000926 ), inició sus labores en el año 1999 y está conformado por profesionales y estudiantes de pregrado y posgrado de diferentes áreas 

Lineas de investigación:

• Biodiversidad y Bioinformática
• La Bioinformática en la Salud
• Desarrollo de herramientas Bioinformáticas

Desarrollo de un método de transcripción inversa seguida de reacción en cadena de la polimerasa para la detección del virus de la fiebre amarilla

Resumen

Introducción. La fiebre amarilla se considera una enfermedad reemergente y endémica en regiones tropicales de África y Suramérica. Actualmente, no existen estuches estandarizados o comerciales disponibles para la detección del virus de la fiebre amarilla y, por lo tanto, el diagnóstico debe hacerse mediante técnicas de rutina que consumen mucho tiempo y algunas veces no garantizan la detección del virus o de sus proteínas. Además, la cocirculación con otros flavivirus, incluyendo el del dengue, hacen el diagnóstico más complicado.

Objetivo. Desarrollar un ensayo específico de amplificación basado en transcripción inversa seguida de reacción en cadena de la polimerasa, con el fin de mejorar la detección y el diagnóstico de la fiebre amarilla, tanto a partir de suero como de tejido fresco.

Materiales y métodos. Se diseñaron iniciadores específicos para amplificar un fragmento conservado del virus de la fiebre amarilla. Un segundo par de iniciadores se usó en una reacción de amplificación anidada para incrementar la sensibilidad. Se probaron 33 muestras clínicas con la técnica estandarizada.

Resultados. El amplímero esperado se obtuvo en 25 de las 33 muestras analizadas usando este método y 2 más resultaron positivas después de la reacción anidada.

Conclusión. Esta técnica mejorada garantiza la detección de todos los genotipos virales de fiebre amarilla y puede incrementar la sensibilidad del ensayo introduciendo una segunda etapa de amplificación, lo cual permite el diagnóstico diferencial con infección por dengue y otros flavivirus, lo cual es de gran importancia para la vigilancia y la toma de medidas epidemiológicas oportunas

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Virus del dengue de serotipo 1 (DENV-1) de Colombia: su contribución a la presentación del dengue en el departamento de Santander

Resumen

Introducción. Los cuatro serotipos del virus del dengue circularon en el departamento de Santander entre 1998 y 2008. No existe información sobre el papel del serotipo 1 (DENV-1) en la epidemiología de la enfermedad.

Objetivo. Analizar la relación entre el cambio de predominancia del (DENV-1) con su diversificación genética, predominancia de los otros serotipos y presentación del dengue grave.

Materiales y métodos. La diversificación genética se estudió por análisis filogenético usando la secuencia del gen E de 12 cepas del virus. Para el análisis se utilizaron datos sobre predominancia delos serotipos obtenidos en estudios previos y datos oficiales de incidencia del dengue.

Resultados. Los virus seleccionados se agruparon en el genotipo V junto a (DENV-1) de países de Latinoamérica y se evidenció segregación en cuatro linajes. Los cambios en la predominancia del virus coincidieron con el reemplazo de linaje y esto, a su vez, con incremento en la prevalencia de DENV-2y DENV-3, e incremento del dengue grave.

Conclusión. La diversificación genética podría contribuir a cambios de predominancia de (DENV-1), y la relación del virus con el DENV-2 y DENV-3 en situaciones que favorecen la presentación de casos graves. Se necesitan más estudios para precisar el papel de los serotipos en la epidemiología del dengue.

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Caracterización molecular de serovariedades de Leptospira spp. aisladas de muestras de animales y agua en Colombia

Resumen

Introducción. La leptospirosis es una infección bacteriana transmitida directa o indirectamente de animales a humanos, la cual puede resultar en una enfermedad hemorrágica grave, hepática o renal y pulmonar. Hay 20 especies de Leptospira conocidas y cientos de serovariedades, algunas de las cuales pertenecen a diferentes especies. Es esencial identificar las serovariedades patógenas y sus reservorios potenciales para enfocar estrategias de control.

Objetivo. Caracterizar las serovariedades de Leptospira aisladas de muestras de roedores, perros, cerdos y agua en Colombia.

Materiales y métodos. Las cepas de leptospiras aisladas fueron identificadas como patógenas usando la reacción en cadena de la polimerasa (PRC). Sus ADN y el ADN deSalmonella Braenderup H9812 (marcador de peso molecular) fueron cortados con NotI y corridos en electroforesis de campo pulsado. Los patrones de la ECP se analizaron con base en los criterios de tipificación para cepas bacterianas y el coeficiente de Dice, cuando se compararon con 200 cepas aisladas en otras partes del mundo. Los perfiles de ADN con un coeficiente de Dice entre 73,7 % y 100 % se consideraron pertenecientes a la misma especie.

Resultados. Todos los aislamientos fueron cepas patógenas y cinco se caracterizaron genéticamente. El aislamiento P275 (coeficiente de Dice: 84 %) y el P282 (coeficiente de Dice: 95 %) de cerdos, se relacionaron con Leptospira interrogans de serovariedad Pomona; el aislamiento de rata (I15) fue indistinguible de Leptospira interrogans de serovariedades Icterohaemorrhagiae o Copenhageni (coeficiente de Dice: 100 %), mientras que los aislamientos de perro (C67) y agua (A42) no se relacionaron (coeficiente de Dice <73,7 %) con ninguna de las 200 cepas de referencia; las más cercanas fueron Leptospira noguchii de serovariedades Nicaragua (coeficiente de Dice: 63 %) y Orleans (coeficiente de Dice: 60 %).

Conclusiones. Esta fue la primera caracterización molecular de serotipos de aislamientos colombianos, los cuales serían los primeros miembros de un panel diagnóstico colombiano.

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UN GEN, MUCHAS PROTEÍNAS

Hasta hace algunos años, uno de los principios básicos de la biología era aquel que afirmaba “un gen, una proteína”. Sin embargo, a lo largo de las dos últimas décadas, los nuevos descubrimientos y el avance de nuestro conocimiento sobre los procesos de transcripción y traducción del ADN han derribado la idea que fue considerada como uno de los dogmas de la genética moderna. Este es un ejemplo más de que en ciencia, el dogma no existe, o no significa lo mismo que en otros campos, especialmente los religiosos.

La relación entre genes y proteínas ha sido un campo muy activo en biología molecular desde el propio descubrimiento de los genes, y lo sigue siendo en la actualidad. A mediados del siglo XX, aun antes de descubrir la naturaleza y estructura del ADN, se comenzó a formar la idea de que un gen constituía un fragmento de información que servía para codificar una proteína, responsable a su vez de un carácter hereditario.

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Parte 1

Parte 2

Centro de Investigación en Biotecnología y Agricultura CIAB

El Centro de Investigación en Biotecnología y Agricultura CIAB, nace como iniciativa de las escuelas académicas de Ciencias Agrícolas, Pecuarias y del medio Ambiente y de Ciencias Básicas, Tecnología e Ingeniería. Su objetivo principal es aportar desarrollo tecnológico acorde a las necesidades y nuevos retos que debe enfrentar el agro colombiano en el contexto de cambio climático, sostenibilidad y soberanía alimentaria.
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PROGRAMA CURRICULAR INGENIERIA BIOLÓGICA

El programa de Ingeniería Biológica está adscrito a la Facultad de Ciencias de la Universidad Nacional de Colombia sede Medellín y su administración está a cargo del Área Curricular de Biotecnología; sus docentes y espacios físicos para prácticas académicas interactúan con las demás escuelas de la Sede y muy especialmente con las de Biociencias, Química, Matemáticas, Física, Estadística y Geociencias; otros espacios y servicios son administrados por dependencias del nivel central como Bienestar Universitario, Dirección de Laboratorios, Centro de Cómputo, Bibliotecas y otros. 

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Desarrollo de programas y proyectos de ciencia, tecnología e innovación que contribuyan a la 

consolidación de la política nacional de CT+I

Fortalecer la conformación y articulación de redes de conocimiento y grupos de investigación, mediante programas de  mediano plazo y proyectos de CT+I, que contribuyan a la solución de necesidades y problemas a través de la generación de conocimiento con relevancia científica, tecnológica, económica, social y competitiva para el país. 

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DESCIFRAN EL GENOMA DE LOS COLOMBIANOS PARA RASTREAR ENFERMEDADES

Esta es la premisa con que el colombiano Leonardo Mariño y el estadounidense King Jordan, fundadores del Instituto Panamericano de Bioinformática, desarrollan un proyecto para entender el genoma de los colombianos, junto a la Universidad del Valle y el Centro de Bioinformática y Biología Computacional (Bios) con sede en Manizales.

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IDENTIFICACIÓN DE NOROVIRUS HUMANO (HNoV) EN MUESTRAS DE ESTIÉRCOL DE CERDOS DOMÉSTICOS

Resumen

Identificación de Norovirus Humano (HNoV) en muestras de estiércol de cerdos domésticos. Objetivo: determinar la presencia  de NoVs como posible agente zoonótico causal de diarrea aguda entre cerdos y humanos. Materiales y métodos: se recolectaron un total de 77 muestras diarreicas provenientes de niños menores de cinco años y de cerdos menores de dos meses de la población. La Chamba en el Tolima, Colombia. Estas muestras fueron transportadas al Laboratorio de Virología de la Pontificia Universidad Javeriana en Bogotá, donde inicialmente se les realizó extracción con Trizol-reagent, siguiendo las instrucciones del fabricante. Una vez obtenido el RNA, el siguiente paso fue hacer la RT-PCR para obtener el producto de amplificacion esperado para NoVs de 213 pb. Finalmente, las muestras positivas obtenidas en la RT-PCR fueron secuenciadas y analizadas mediante métodos bioinformáticos. Resultados: se obtuvieron seis muestras positivas de diarrea de niños y una muestra positiva de diarrea de cerdos,  las cuales se evidenciaron en una banda de 231 pb. Cinco de las seis muestras positivas en niños y la muestra positiva en cerdos fueron secuenciadas y analizadas. Conclusiones: dada la estrecha relación genética que se evidencia entre las secuencias del cerdo y el humano, este podría ser un indicio de que exista la posibilidad de un animal en común como reservorio para cepas de humano u otras cepas de animales.

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PRIMER REPORTE DE CRYPTOSPORIDIUM PARVUM EN TERNEROS HOLSTEIN DE MANIZALEZ, CALDAS, COLOMBIA.

RESUMEN 

El objetivo de este estudio fue identificar especies o genotipos del protozoario parásito  Cryptosporidium presentes en heces colectadas de terneros Holstein del municipio de  Manizales, departamento de Caldas, Colombia. el adn fue extraído a 80 muestras  de materia fecal, de las cuales 11 fueron diagnosticadas positivas para Cryptosporidium spp., mediante reacción en cadena de la polimerasa (PCr). el análisis PCr-rFLP  del locus 18s adnr, identificó la presencia de Cryptosporidium parvum en todas las  muestras positivas analizadas. este hallazgo sugiere que el ganado puede ser una fuente potencial de infección por Cryptosporidium en humanos y se constituye en el primer reporte publicado de C. parvum en bovinos de Manizales, Caldas.

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Beca Investigador Visitante Colombiano

La Beca Investigador Visitante Colombiano ofrece a cinco (5) académicos colombianos la oportunidad de vincularse a una universidad o instituto de investigación estadounidense durante un semestre en el año académico 2014-2015 para realizar investigación avanzada. A través de este programa Fulbright apoya la investigación en el país, promueve la colaboración investigativa entre Colombia y Estados Unidos y fomenta la inserción de Colombia en las redes globales de conocimiento.

Abierta del 5 de agosto al 1 de noviembre de 2013

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PREDICCIÓN COMPUTACIONAL DE ESTRUCTURA TERCIARIA DE LAS PROTEÍNAS HUMANAS Hsp27, aB- CRISTALINA Y Hspb8

Resumen

Objetivo. Realizar predicciones computacionales de estructura de las proteínas humanas Hsp27, αB cristalina y HspB8. Materiales y métodos. La predicción de la estructura secundaria se obtuvo mediante un consenso de los programas de predicción secundaria GOR 4, nnPred, Sspro, APSSP2, JPredict, Porter, Prof, SOPMA, HNN y Psi-Pred. Los modelos de estructura terciaria se elaboraron a partir de fragmentos homólogos de proteínas con estructura terciaria conocida que fueron obtenidos por múltiples alineamientos. Empleando la secuencia primaria se obtuvieron perfiles de antigenicidad de las proteínas nativas y fueron analizados los perfiles de hidrofobicidad, polaridad, flexibilidad, accesibilidad tanto de las proteínas nativas como de las mutadas. Resultados. Las predicciones de estructura secundaria y terciaria de las proteínas estudiadas muestran que en los tres casos, más del 65% son regiones en coil, 20-25% en hoja plegada y menos del 10% en alfa hélice. Los análisis de estructura primaria muestran que al menos uno de los perfiles estudiados, en cada mutación está alterado. Conclusiones. Los análisis comparativos de estructura sugieren que las mutaciones afectan la solubilidad de las proteínas mutadas y con ello su función como chaperonas moleculares.

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Becas para estudios académicos (Grado, Maestrías y Doctorados)

El Programa de Becas Académicas de la OEA (Programa Regular), establecido en 1958, otorga cada año becas para maestrías, doctorados o investigación conducente a un título. El Programa de Becas Especiales para el Caribe Angloparlante (SPECAF), establecido en 1983, otorga becas para los últimos dos años de estudios universitarios a los ciudadanos y residentes de los Estados Miembros del caribe angloparlante. Estos se rigen por el Manual de Procedimientos de Becas OEA. Además de estos programas, la OEA, a través de su Programa de Alianzas para la Educación y la Capacitación (PAEC), ofrece otras oportunidades de becas para estudios académicos con el apoyo de sus instituciones socias en las Américas y alrededor del mundo. El PAEC es administrado conforme a los respectivos acuerdos de cooperación siguiendo los principios previstos en el Manual de Procedimientos de Becas OEA.

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EL ALGORITMO HyRPNI Y UNA APLICACIÓN EN BIOINFORMATICA

RESUMEN

Proponemos un algoritmo de inferencia gramatical  para lenguajes regulares que permite ahorrar cómputo  al usar dos criterios diferentes para elegir los estados  a ser procesados, un criterio se usa en la primera fase del proceso de inferencia (al principio) y el otro en  el resto del proceso. Realizamos experimentos para observar el desempeño del algoritmo, para aprender  sobre el tamaño ideal de su primera fase y para mostrar su aplicación en la solución de un problema especifico en bioinformatica: la predicción de sitios de corte en poliproteinas codificadas por virus de la familia Potyviridae.

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20 becas para estudiar en Alemania

¡Son 20 becas para estudiar en Alemania para estudiantes de Latinoamerica! Tienes hasta el 20 de Septiembre para postularte a pregrado o maestría Por parte de:

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Epidemiología y bioinformática en el estudio de la Leucemia Linfoma de Células T del Adulto asociada a la infección con VLHT-1

RESUMEN

Objetivos: Establecer la relación entre el número de provirus VLHT-1 y las características de la cromatina adyacente en casos de Leucemia Linfoma de Células T del Adulto. 

Metodología: Se realizó una revisión sistemática y un metaanálisis de la literatura publica que considero como variables de estudio los provirus por cromosoma y características estructurales y funcionales de la cromatina adyacente a los sitios de integración. La concordancia entre los resultados de la evaluación que emitieron dos expertos fue evaluada con el coeficiente de Spearman Rho. Se evaluó el sesgo de publicación mediante el gráfico de embudo y el estadígrafo Egger. De acuerdo con los resultados de la evaluación de la heterogeneidad se aplicó el modelo de efectos fijos para la combinación de los resultados de las integraciones que ocurrieron en: secuencias codificantes y secuencias codificantes de acuerdo con su función molecular. 

Resultados La concordancia entre expertos evaluadores fue de 0,7. No se encontró sesgo de publicación. Se determinó homogeneidad entre los estudios seleccionados (p>0,05). El provirus VLHT-1 se integró en secuencias en regiones teloméricas y subteloméricas. La combinación de los resultados mostró una integración sitio dirigida hacia regiones codificantes del genoma humano (p<0,05). 

Conclusion: En su conjunto los resultados permiten concluir que la integración proviral no es al azar en LCCTA; esta ocurrió en regiones reguladoras o de control; que explicarían algunos de los proceso moleculares  involucrado en leukomogénesis

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IDENTIFICACIÓN DE ELEMENTOS cis-REGULATORIOS Y PREDICCIÓN BIOINFORMÁTICA DE FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN INVOLUCRADOS EN LA REGULACIÓN DE miARNs EN PLANTAS

RESUMEN

Los microARNs (miARNs) son pequeños ARN no codificantes que juegan un papel importante en el control de la expresión génica a través de la degradación de ARNm complementarios a su secuencia. La expresión de los miARNs es dependiente de la ARN polimerasa II como la mayoría de genes que codifican para proteínas. La regulación de  la expresión de miARNs está bajo el control coordinado y combinatorio de factores de transcripción (FT). En este trabajo, se realizó una aproximación bioinformática para identificar sitios de unión de FT, TFBS (del inglés Transcription Factors Binding Sites) en regiones promotoras de genes miRNAs en 17 especies vegetales y se analizó el papel de algunos FTendefensa contrabacterias. Se encontróquenuevede lasplantas analizadas presentaban diferencias significativas entre la distribución de TFBS presentes en los promotores de los miRNAs cuando se compara con los presentes en los genes codificantes de proteínas. En varios de los promotores de los miRNAs de yuca que son inducidos en respuesta a la infección por la bacteria Xanthomonas axonopodis pv. manihotis se identificaron elementos de unión como CCA1, T-box y SORLREP3, los cuales se presentan tambiénenlos genesque codifican proteínas implicadas enrespuestas al ciclo circadiano y a la luz,sugiriendo que estos procesos y las respuestas inmunes en plantas pueden ser coordinados. En conjunto este trabajo aporta luces sobre los posibles mecanismos transcripcionales del control de la expresión génica de los miARNs.

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XII Congreso Interamericano de Microscopía (CIASEM 2013)

 El Comité Interamericano de Sociedades de Microscopía (CIASEM) y la Asociación Colombiana de Microscopía (ASOCM) se complacen en invitarlos a participar en el próximo encuentro bianual en Colombia, al XII Congreso Interamericano de Microscopía (CIASEM 2013).

CIASEM es una organización regional inscrita de la Federación Internacional de Sociedades de Microscopía (IFSM).

Cada dos años se encarga de organizar el Congreso Inter-americano de Microscopía, que en esta oportunidad se llevará a cabo en la ciudad de Cartagena de Indias, Colombia. 

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20 becas de doctorado en biología

El International PhD Program in the Biological Sciences del Max Planck Institute for Developmental Biology y el Friedrich Miescher Laboratory en Tübingen ofrece 20 becas de doctorado. Fecha de cierre: 15 de septiembre de 2013. Mayor información.

Evento que busca socializar las actividades y resultados de investigación y desarrollo en biología computacional y áreas afines, en el ámbito Colombiano, como base para promover la identificación y desarrollo de proyectos nacionales con posible colaboración e impacto internacional.

Horario: del 25 al 27 de septiembre del 2013.

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Mosquitos transgénicos para combatir la epidemia de dengue

Dos son las necesidades básicas de todo animal: saciar el hambre y reproducirse. Si lo primero está en la base de los picotazos que las hembras del mosquito Aedes aegypt propinan a los humanos para obtener su sangre —proceso durante el cual le inoculan el virus del dengue—, lo segundo es la base de la última de las soluciones que se ensayan para frenar la enfermedad.

Después de algunos intentos a menor escala, Brasil lidera la idea: se trata de soltar machos modificados genéticamente para tener crías no viables. Con eso, sacian el afán reproductor de la hembra, y se espera reducir la población de insectos. En esta línea, la ciudad de Juazeiro en el interior del Estado de Bahía, se ha convertido en el primer laboratorio en el que las autoridades sanitarias han asumido el reto de reducir la incidencia del dengue a través de la liberación de millones de mosquitos transgénicos. Allí se inauguró el 7 de julio la primera biofábrica de la Organización Social Moscamed,donde se crían semanalmente medio millón de Aedes aegypt genéticamente modificados. En la misma ciudad, perdida en el campo del noreste brasileño y conocida por ser donde nació el legendario maestro de la bossa nova Joao Gilberto, investigadores de Moscamed han soltado cada semana miles de insectos con el objetivo de frenar el avance de una de las epidemias que más preocupan anualmente al Gobierno.

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Descifran la maquinaria de ataque de las bacterias

Descifran la maquinaria de ataque de las bacterias

Publicado en la revista ‘Nature Chemical Biology’, este descubrimiento ofrece nuevas pistas sobre la lucha contra los patógenos que son cada vez más resistentes a los antibióticos. Para atacar a la célula huésped, el arma debe primero conectar. El mecanismo del agresor es compuesto de siete proteínas que se pliegan sobre sí y se ensamblan en un anillo y estas largas moléculas, con el tiempo, se desarrollan para formar una especie de espolón.

El disparador es sólo otra parte de la máquina, un péptido, o una pequeña molécula orgánica, que cuando se expone a las enzimas del organismo huésped, se separa. El balance de la unión se ajusta: las proteínas adoptan una nueva forma, que tiende a un movimiento circular para formar un espolón, que luego atraviesa la membrana de la célula huésped.

Ninguna reacción química está involucrada en este tipo de armas biológicas, sino que se trata de un fenómeno mecánico, aunque a nivel molecular. Matteo Dal Peraro, coautor de este estudio, también utiliza el término “nano máquina” para referirse a esta herramienta de agresión bacteriana.

Los investigadores de la EPFL han trabajado en cepas de ‘Aeromonas hydrophila’, una bacteria bien conocida entre los viajeros por los trastornos intestinales que causa. En placas de Petri, los investigadores lograron intencionadamente causar la formación de estos dardos, exponiendo de este modo los microorganismos a las enzimas digestivas, y fueron capaces de modelar con precisión cómo cada proteína se reordena de forma dinámica, una vez que el péptido no está, para formar el espolón.

Para otro de los autores, Gisou Van der Goot, este descubrimiento abre nuevas perspectivas terapéuticas, por ejemplo en los casos de infección por estafilococos nosocomiales. “Podríamos imaginar catéteres recubiertos con péptidos de sustitución -dice–. “Se podría prevenir la formación del anillo y, por lo tanto, el espolón. 
Queremos evitar muchas infecciones en los hospitales”.

La idea es abordar el armamento de las bacterias en lugar de la propia bacteria, algo particularmente atractivo en un momento en el que múltiples resistencias a los antibióticos se están volviendo cada vez más comunes. “Este enfoque tendría la ventaja de no causar mutaciones, y con ello, la resistencia de bacterias patógenas”, concluye el investigador.

Links de interes:
 
http://www.europapress.es/salud/noticia-descifran-maquinaria-ataque-bacterias-20130804190815.html
http://phys.org/news/2013-08-nano-machine-cell-killer-team-deciphers.html

Epigenética: definición, bases moleculares e implicaciones en la salud y la evolución humana.

Resumen

La Epigenética se refiere a los cambios heredables en el ADN e histonas que no implican alteraciones en la secuencia de nucleótidos y modifican la estructura y condensación de la cromatina, por lo que afectan la expresión génica y el fenotipo. Las modificaciones epigenéticas son metilación del ADN y modificaciones de histonas. Objetivo: hacer una revisión de la literatura sobre el  concepto de epigenética y su impacto en la salud. Materiales y métodos: se realizó una revisión  de la bibliografía sobre el concepto de epigenética, sus bases biológicas, el impacto sobre la salud  y la enfermedad y su relación con la evolución. Resultados: los mecanismos epigenéticos han  cobrado cada vez más importancia debido a la creciente asociación con enfermedades complejas  y comunes, así como por su impacto en la salud de generaciones futuras y en la evolución humana. Conclusiones: la Epigenética tiene un claro impacto en la salud del individuo, en la de su  descendencia y en la evolución de la especie humana.

Palabras clave: procesos epigenéticos, metilación del ADN, histonas, evolución biológica.

Introducción

Concepto

El término Epigenética fue acuñado en la década del cincuenta para describir el mecanismo  por el cual los organismos multicelulares desarrollan múltiples tejidos diferentes a partir de  un único genoma. En la actualidad reconocemos  que este proceso se logra mediante marcas moleculares detectables; dichas marcas generan  modificaciones que afectan la actividad transcripcional de los genes y una vez establecidas son relativamente estables en las siguientes  generaciones (1).El uso actual del término  consiste en indicar cambios heredables en la estructura y organización del ADN que no involucran cambios en la secuencia y que modulan la expresión génica. Estos cambios en la  expresión génica implican, entonces, cambios heredables en el fenotipo (1-3). Los mecanismos tradicionales de regulación epigenética  incluyen metilación del ADN y modificaciones de histonas, entendiendo a estas proteínas  como las encargadas de empaquetar el ADN y  considerando que los dos tipos de mecanismos participan en la modulación de los complejos remodeladores de la cromatina (1-2). En esta  revisión abordaremos los mecanismos tradicionales de la regulación epigenética descritos anteriormente (2).

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Oferta laboral BIOS

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Becas

Becas para PhD en Genética de Poblaciones

Estudiantes sobresalientes con experiencia en bioinformática, estadística, genética evolutiva, genética funcional, genética de poblaciones teóricas o experimentales son elegibles para aplicar para esta posición. Los solicitantes serán recibirán un sueldo de 34.700,00 euros (antes de impuestos) de acuerdo con las regulaciones del Austrian Science Fund (FWF).

Los estudiantes altamente motivados de disciplinas afines, como la física o las matemáticas, también son bienvenidos a aplicar.

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Evento CDMB

CDMB organiza evento de socialización de datos sobre biodiversidad

Conscientes de la importancia que tiene la información sobre biodiversidad en la toma de decisiones en la gestión ambiental de nuestro territorio, la CDMB, el SiB y el Jardín Botánico Eloy Valenzuela, preparan para el próximo 24 de Mayo un importante evento académico denominado “Socialización sobre gestión y publicación de datos sobre biodiversidad”. El encuentro cuenta con el apoyo del Sistema de Información sobre Biodiversidad de Colombia (SiB), y busca “presentar el modelo para la publicación de datos sobre biodiversidad propuesto por el SiB Colombia, el cual usa estándares, metodologías y herramientas informáticas reconocidas y adoptadas a nivel internacional e incentivos para los publicadores de datos sobre el tema”.

La agenda de trabajo está programada para desarrollarse de 8 a 11 de la mañana, en el auditorio del Jardín Botánico de la CDMB.

El SiB Colombia, es una red de redes, encargada de facilitar herramientas para la integración, publicación y consulta de la información sobre biodiversidad, para hacerla fácilmente disponible a los usuarios. De esta manera, aunque se permite el acceso y el uso de la información a través de en una sola plataforma, se garantiza que ésta sea apropiadamente utilizada y su autoría reconocida.

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Convocatoria a la Biodiversidad

Convocatoria Nacional a la Biodiversidad

La Empresa y Minambiente lanzaron la III Convocatoria Nacional a la Biodiversidad. Ecopetrol destina $4.000 millones para proteger el bosque seco en Colombia.

• Las propuestas para ser financiadas se recibirán hasta el próximo 5 de julio.
• En las dos convocatorias anteriores se apoyaron 22 proyectos en 19 departamentos con un total de US$7,7 millones.

Una de las más importantes iniciativas para el apoyo de la investigación, preservación, conservación y manejo sostenible de la biodiversidad en ecosistemas estratégicos del país llega a su tercera edición. La Convocatoria Nacional a la Biodiversidad, liderada por Ecopetrol y el Ministerio de Ambiente y Desarrollo Sostenible, se enfocará esta vez en proyectos que le apuesten al bosque seco.

El bosque seco tropical es considerado como uno de los ecosistemas más representativos en nuestro Sistema Nacional de Áreas Protegidas y, con una supervivencia actual de tan solo el 3% de su cobertura original, hoy día sobrevive en parches aislados por todo el país. Colombia se ha fijado metas para su conservación y Ecopetrol y el Ministerio del Medio Ambiente estiman aportar al cumplimiento de las mismas a través del desarrollo de la III Convocatoria.

Las dos anteriores convocatorias apoyaron en su totalidad, 22 proyectos sobre humedales en los departamentos de Risaralda, Boyacá, Cundinamarca, Magdalena, Guajira, Bolívar, Córdoba, Santander, Bolívar, Nariño, Valle del Cauca, Santander, Meta, Vichada, Cesar, Caldas, Casanare, Huila y Antioquia.

Algunos ejemplos financiados por la Convocatoria

La Universidad del Magdalena Medio desarrolló un estudio genético del bocachico que permitió determinar que, pese a ser el más ancestral, este pez de la cuenca del Magdalena cuenta con una diversidad genética muy baja, causada entre otros por mal manejo durante los procesos de reproducción y repoblamiento. Los resultados del proyecto se aportaron a la Autoridad Nacional de Pesca que utilizará los resultados para reglamentar el uso de alevinos a nivel nacional.

Las propuestas que participen en esta tercera convocatoria deben presentarse en medio físico en Ecopetrol en su sede de Bogotá, en el  Edificio Guadalupe Calle 37 No. 7-43 piso 4, antes del 5 de julio de 2012. 

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La bioinformática crece en Colombia

Durante tres días, expertos de Colombia y el mundo analizarán las perspectivas de desarrollo de la biología computacional y revisaran sus principales aplicaciones.

La anotación del genoma humano se logró en gran parte gracias a las ciencias de la informática. Estos progresos generan una gran cantidad de datos cuyo análisis demanda el uso de herramientas computacionales altamente especializadas. El desarrollo de estas herramientas tiene por nombre bioinformática.

Con el uso de la biología computacional ha sido posible empezar la anotación de los genomas y la elaboración de mapas genéticos y físicos cada vez más complejos, incluyendo genomas de organismos no celulares. Pero es aquí donde se hace más necesaria la bioinformática, con la cual se pueden transformar esos datos en información útil que permita el desarrollo de nuevas tecnologías para la elaboración de medicamentos, pruebas de paternidad, alimentos y nuevos avances en la curación de enfermedades, entre otros usos.

El desarrollo de esta ciencia en Colombia comenzó hace diez años a partir de cursos de formación. Desde entonces, en el país se ha avanzado no solo en el número de personas que la usan, sino en la aparición de investigadores con formación de doctorado que hacen desarrollos interesantes y competitivos en biología computacional.

“Hace diez años, los sistemas de investigación en biología eran difíciles de utilizar porque era muy costoso el equipo. Ahora las técnicas están disponibles a costos muy bajos que permiten que con los presupuestos que tenemos se puedan acceder a las técnicas o contratarlas tanto en Colombia como en el extranjero y recibir los datos. Vamos a tener una masa muy grande de datos y una necesidad creciente de crear herramientas para implementarlas y aprovecharlas para sacar la mayor información de los experimentos que hacemos”, comentó Emiliano Barreto, director del Centro de Bioinformática de la UN en Bogotá.

Hay centros especializados a nivel mundial en mantener y desarrollar ese tipo de herramientas. Por ejemplo, en Estados Unidos existe el Centro Nacional de Información para la Biotecnología, que cuenta con la base de datos de todas las secuencias de ADN que los investigadores han querido reportar en el mundo. Esa base de datos tiene 300 millones de secuencias y está disponible y preservada para que cualquier persona en el mundo pueda consultar la base de datos.

La bioinformática en la UN

“En el 2001 creamos los primeros cursos permanentes a nivel de posgrado, hay algunos cursos en el Instituto de Biotecnología y en las facultades de Ciencias e Ingeniería que han manejado algunos proyectos específicos, lo cual nos ha permitido tener estudiantes de maestría haciendo trabajos de investigación y estudiantes de pregrado que hacen sus trabajos finales en bioinformática. En la actualidad se propuso la creación de una maestría en biología computacional”, explicó Barreto.

El congreso comenzará el 23 de marzo y vendrán invitados especiales de Estados Unidos, Europa y Chile. El evento se realizará en la Biblioteca Virgilio Barco y cuenta con la coordinación de la Universidad Nacional, la Universidad de Los Andes y la colaboración de más de diez instituciones de todo el país.

Desarollan en Cali software para bioinformática

Permite filtrar y cuantificar la carga de datos provenientes del análisis de proteínas.

La primera versión del programa tomó un año de desarrollo, la segunda, con mejoras y aplicaciones ampliadas, lleva 6 meses de construcción. 

Omics Hub, como se llama el programa, se usa en los principales centros de investigación vinculados a hospitales de España y Alemania, donde digitalizan información para representar gráficamente expresiones proteicas, con las cuales se pueden elaborar nuevos fármacos.

Parquesoft Cali es la compañía a la que se encuentra adscrita el grupo que creó el software de bioinformática. 300 empresas más hacen parte de ella. 

Salvar el medio ambiente

Plan multimillonario para proteger biodiversidad

 

La biodiversidad nacional vivirá una de sus mejores épocas en la próxima década. Por lo menos así lo plantea 'Naturalmente Colombia', un plan lanzado por el Ministerio de Medio Ambiente con el que se destinarán 300 millones de dólares en 10 años (540 mil millones de pesos aproximadamente) para impulsar la conservación y protección de más de 2 millones de hectáreas, en tres ecosistemas que hoy están desprotegidos: áreas marinas, bosques secos y sabanas en la Orinoquia.

'Naturalmente Colombia' se convierte en el proyecto más ambicioso de los últimos años para rescatar porciones de biodiversidad que están sin protección, a pesar de su valor ecológico y ambiental.

Entre los objetivos está, además, cumplir los compromisos internacionales del Convenio de Diversidad Biológica, firmados en Nagoya (Japón) en 2010, que estableció que los países deben proteger el 17 por ciento de su territorio terrestre y el 10 del marino; hoy Colombia está en déficit frente a esas metas, porque sus áreas de reserva terrestres alcanzan el 12 por ciento del mapa. De las porciones de costas y mares están protegidas menos del 2 por ciento del total.

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Maestría en Genética Humana

MAESTRÍA EN GENÉTICA HUMANA

 

DIRIGIDO A:

Profesionales del área Biomédica y Ciencias Biológicas. (Medicina, Bacteriología, Microbiología, Bioquímica, Farmacia, Enfermería, Odontología, Biología, Química).

 

PRESENTACIÓN

Programa creado en 1978, mediante Acuerdo 133 del Consejo Superior de la Universidad, y modificado por los Acuerdos No. 03 y 30 de 1998 del Consejo de Sede, Acuerdo No. 09 de 1999 del Consejo de Sede, Acuerdo No. 143 de 2002 del Consejo Académico y Acuerdo No. 185 de 2008 del Consejo Académico de la Universidad Nacional de Colombia.

Se rige por el reglamento de Estudios de Postgrado de la Universidad, Acuerdo 020 de 2001 del Consejo Académico y Acuerdo 033 de 2007 y 008 de 2008 del Consejo Superior Universitario de la Universidad Nacional de Colombia.

 

INFORMACIÓN GENERAL

Nivel de formación: Posgrado
Tipo de plan de estudios: Maestría en Investigación
Título otorgado: Magister en Genética Humana
Sede: Bogotá
Facultad: Medicina
Área curricular: Maestría en Genética Humana                 
Duración: Dos años
Número de créditos: 75 Créditos
Jornada: Diurna
Modalidad: Presencial
Admisión: Anual

 

INFORMACIÓN GENERAL DEL PROCESO DE ADMISIÓN

Requisitos, Ponderación De Las Pruebas, Costos, Documentación Y Cupos.
El proceso de Admisión es convocado por la Dirección Nacional de Admisiones www.admisiones.unal.edu.co, donde se publicará paso a paso los trámites a seguir en la convocatoria.

 

 REQUISITOS DE ADMISIÓN

• Poseer título universitario.
• Presentar documentación requerida.
• Diligenciar formulario de inscripción.
• Presentar las pruebas de conocimientos generales e inglés, y de conocimientos específicos.
• Entrevista.
• Un promedio de 3.5

En el ítem de presentar documentación requerida se anexan los siguientes datos:

• Hoja de Vida (Formato de word).
• Datos Básicos, Publicaciones, Trabajos de Investigación, Distinciones Académicas.
• Copia del Acta de Grado
• Copia del Diploma
• Fotocopia del Certificado de Notas con promedio (en caso de ser admitido es necesario tener el certificado de Notas originales)
• Fotocopia de la Cédula Ampliada
• Fotocopia de la inscripción y consignación.

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Peligro a la agronomía

Erosión genética en el agro, una amenaza latente

Por escaso que pueda parecer, cualquier estudio en este campo representa un gran esfuerzo en términos económicos y logísticos por parte de las entidades responsables de conservar la agrobiodiversidad. Este patrimonio genético representa uno de los pilares de la seguridad alimentaria del país. Lamentablemente, como en otras partes del mundo, está en proceso de erosión.

Desarrollos metodológicos y científicos de bajo costo, adaptados a las condiciones de países como Colombia, llegan para ofrecer soluciones con el fin conservar el patrimonio genético vegetal.

El aspecto menos conocido de la riqueza biológica colombiana es su agrobiodiversidad. En Colombia no existen estudios ni datos consolidados sobre esa erosión genética en plantas cultivadas y sus parientes silvestres; algo evidentemente grave, pues estarían ocurriendo grandes pérdidas en un escenario de absoluto desconocimiento. Eso se evidencia en las cifras, pues la WWF estima que en el planeta se ha perdido un 75% de esa abundancia en el último siglo.

Ha sido un sacrificio necesario seleccionar unas pocas especies en pos de obtener una mejor variedad, con fines alimentarios. Los grandes avances de la agricultura han ido de la mano de la domesticación y el fitomejoramiento, a pesar de la reducción genética que, irremediablemente causan.

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Los retos de alimentar a la humanidad en un mundo cada vez más caliente

La Fundación para la tecnología y la Innovacion (ITIF) de Estados Unidos y el Colegio de Económicas de Londres (LES) de Reino Unido han publicado el informe "Alimentando el planeta en un mundo que se calienta. Construyendo agricultura resistente a través de la innovación", un análisis de los retos de alimentar una población en constante crecimiento ante el constante aumento de temperaturas del planeta. Se analiza así el papel de las variedades mejoradas para resistir a condiciones climatológicas extremas.

Las proyecciones de crecimiento de la población implican que para mantener el mismo nivel de vida actual la agricultura tendrá que producir un 70% más de aquí a 2050 para poder alimentar a los 9.300 millones de personas que habitarán el planeta. A este reto hay que sumarle el cambio climático y las limitaciones ambientales de todo el mundo, algo que está haciendo la actividad agrícola cada vez más complicada.

Ante este complejo panorama la agricultura resistente a condiciones climatológicas extremas es clave para lograr el incremento productivo demandado sin tener que aumentar la superficie de tierra cultivable. Una vía tecnológica por la que se debe apostar sind dejar de lado el resto de formas agrarias existentes. Biotecnología agraria cada vez más necesaria y demandada que está viendo su progreso frenado en muchos países.

El informe rechaza las barreras regulatorias sin base científica que están frenando en muchos países el progreso de la biotecnología agraria. Además, también critica la falta de inversión en investigación en este área. Por ello el informe concluye que hace falta fortalecer la apuesta en biotecnología verde y una fuerte implicación política para adelantarse a los problemas alimenticios venideros.

Se presentó el nuevo marco regulatorio en Biotecnología

El Ministerio de Agricultura, Ganadería y Pesca de la Nación, presentó hoy el nuevo marco regulatorio para Biotecnología Agropecuaria que consolida el crecimiento del área en beneficio de los productores y hace eje en una mayor accesibilidad y agregado de valor.

El secretario de Agricultura, Ganadería y Pesca de la Nación, Lorenzo Basso, fue el encargado de abrir la jornada, en representación del ministro de Agricultura, Norberto Yauhar. Lo acompañaron el Director de Biotecnología, Martín Lema; el Director Nacional de Procesos y Tecnologías , Juan Manuel Alderete, y el presidente de la Asociación Semilleros Argentinos (ASA), Alfredo Paseyro.

"La idea comenzó a gestarse hace tres años luego de la creación del Ministerio, y se concretó en la gestión de 2012, desde entonces pensamos en mejorar el marco que ya tenía muchos años y crear más bioseguridad e inocuidad, pero al mismo tiempo hacerlo mas ágil al proceso de análisis, a partir del trabajo de la Dirección de Biotecnología, el SENASA y la CONABIA", destacó Basso.

El contenido del nuevo marco fue compendiado en una publicación dirigida tanto a los usuarios del sistema regulatorio como al público en general interesado en la materia. Este proceso de actualización normativa implica notables avances sobre la base de una producción agropecuaria y agroindustrial que garantice la sustentabilidad del agroecosistema y la seguridad alimentaria.

El agregado de valor y la búsqueda permanente de nuevas tecnologías motiva el perfeccionamiento permanente de las herramientas legales necesarias para permitir tanto a los desarrolladores como al Estado Nacional, adoptar los beneficios de la biotecnología, concebida como una herramienta estratégica de desarrollo productivo.

En este sentido, este marco contempla los posibles riesgos que entraña toda actividad productiva. Asimismo, presenta con detalle, los pasos a seguir por los desarrolladores para solicitar permisos sobre proyectos de experimentación en Organismos Genéticamente Modificados (OGM).

Por su parte, el titular de ASA, Alfredo Paseyro sostuvo que "esto nos da mayor previsibilidad, celebramos un marco regulatorio claro, que nos marca el camino a seguir. Y nosotros tenemos una responsabilidad en este rumbo que es producir más y mejores alimentos para el mundo".

A su vez, en el marco de la jornada, Basso se refirió a un nuevo evento biotecnológico en soja de la empresa BASF, desarrollado en colaboración con la brasileña EMBRAPA. "Hay cada vez más variantes en el mercado, para que los productores tengan más soluciones de trabajo", destacó el funcionario.

Y agregó: "hoy llevamos 28 eventos aprobados en total, de los cuales hay 15 que fueron aprobados en los últimos 3 años, mientras el resto llevaron 20 años".

En tanto, el Director de Biotecnología, Martín Lema, resaltó más allá del marco normativo "la decisión política del ministro Yauhar de crear la Subsecretaría de Agregado de Valor y Nuevas Tecnologías, que da lugar a un trabajo más coordinado y de mayor sinergia de nuestra área con la de Procesos y Tecnologías y la de Coordinación Ambiental".

Entre los expositores, también estuvieron presentes el coordinador de biotecnología y bioseguridad de, Instituto Interamericano de Cooperación para la Agricultura (IICA), Pedro Rocha, y Gladys Huerga del área de Biotecnología del MAGyP.