Inscripciones abiertas al proceso de admisión a la Maestría en Bioinformática para el primer semestre de 2014. 

TITULO: MAGÍSTER EN BIOINFORMÁTICA

HORARIO: Los cursos ofrecidos por la Maestría se programan entre lunes y viernes, generalmente en dos sesiones de 7:00 a 9:00 a.m. 6:00 a 8:00 p.m.

El plan de estudios de investigación de la Maestría en bioinformática tiene una duración de cuatro (4) semestres.

La Maestría en Bioinformática en la Universidad Nacional de Colombia basada en las capacidades alcanzadas por la Universidad tanto de docencia como investigación en el área de la bioinformática, es un programa de Posgrado Interdisciplinario dirigido a la formación avanzada de profesionales en bioinformática capaces de plantear, analizar y resolver problemas en ciencias de la vida, fortalecer este campo de conocimiento y consolidar una comunidad científica que contribuya al avance del conocimiento biológico.

La Maestría en Bioinformática esta basada en las siguientes líneas de investigación: Biología funcional y estructural, Biología de Sistemas y Tecnologías computacionales en Bioinformática, con el soporte de varios grupos de investigación, de reconocida experiencia en cada una de estas.

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BIOSTEC 2014

El propósito de Biostec es reunir a investigadores y profesionales, incluyendo ingenieros, biólogos, profesionales de la salud y la informática / informáticos, interesados ​​tanto en los avances teóricos y las aplicaciones de los sistemas de información, inteligencia artificial, procesamiento de señales, electrónica y otras herramientas de ingeniería en las áreas de conocimiento relacionados con la biología y la medicina. Biostec se compone de cinco conferencias  co-localizados, cada uno especializado en al menos una de las áreas de conocimiento principales antes mencionados.

Más información

Talleres Internacionales de Bioinformática 2014

 

 

El Nodo Nacional de Bioinformática (NNB-UNAM) y la Sociedad Iberoamericana de Bioinformática (SoIBio), con el apoyo del Centro de Ciencias Genómicas (CCG-UNAM), el Instituto de Biotecnología (IBt-UNAM), la Licenciatura en Ciencias Genómicas (LCG-UNAM), la Facultad de Medicina de la UAEM y EMBnet organizan los "Talleres Internacionales de Bioinformática 2014", que se llevarán a cabo del 13 al 24 de Enero de 2014 en las instalaciones del CCG en Cuernavaca Morelos, México.

Centro de Bioinformática del Instituto de Biotecnología (CBIB).

El Centro de Bioinformática del Instituto de Biotecnología de la Universidad Nacional de Colombia (clasificado por COLCIENCIAS: COL0000926 ), inició sus labores en el año 1999 y está conformado por profesionales y estudiantes de pregrado y posgrado de diferentes áreas 

Lineas de investigación:

• Biodiversidad y Bioinformática
• La Bioinformática en la Salud
• Desarrollo de herramientas Bioinformáticas

Desarrollo de un método de transcripción inversa seguida de reacción en cadena de la polimerasa para la detección del virus de la fiebre amarilla

Resumen

Introducción. La fiebre amarilla se considera una enfermedad reemergente y endémica en regiones tropicales de África y Suramérica. Actualmente, no existen estuches estandarizados o comerciales disponibles para la detección del virus de la fiebre amarilla y, por lo tanto, el diagnóstico debe hacerse mediante técnicas de rutina que consumen mucho tiempo y algunas veces no garantizan la detección del virus o de sus proteínas. Además, la cocirculación con otros flavivirus, incluyendo el del dengue, hacen el diagnóstico más complicado.

Objetivo. Desarrollar un ensayo específico de amplificación basado en transcripción inversa seguida de reacción en cadena de la polimerasa, con el fin de mejorar la detección y el diagnóstico de la fiebre amarilla, tanto a partir de suero como de tejido fresco.

Materiales y métodos. Se diseñaron iniciadores específicos para amplificar un fragmento conservado del virus de la fiebre amarilla. Un segundo par de iniciadores se usó en una reacción de amplificación anidada para incrementar la sensibilidad. Se probaron 33 muestras clínicas con la técnica estandarizada.

Resultados. El amplímero esperado se obtuvo en 25 de las 33 muestras analizadas usando este método y 2 más resultaron positivas después de la reacción anidada.

Conclusión. Esta técnica mejorada garantiza la detección de todos los genotipos virales de fiebre amarilla y puede incrementar la sensibilidad del ensayo introduciendo una segunda etapa de amplificación, lo cual permite el diagnóstico diferencial con infección por dengue y otros flavivirus, lo cual es de gran importancia para la vigilancia y la toma de medidas epidemiológicas oportunas

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Virus del dengue de serotipo 1 (DENV-1) de Colombia: su contribución a la presentación del dengue en el departamento de Santander

Resumen

Introducción. Los cuatro serotipos del virus del dengue circularon en el departamento de Santander entre 1998 y 2008. No existe información sobre el papel del serotipo 1 (DENV-1) en la epidemiología de la enfermedad.

Objetivo. Analizar la relación entre el cambio de predominancia del (DENV-1) con su diversificación genética, predominancia de los otros serotipos y presentación del dengue grave.

Materiales y métodos. La diversificación genética se estudió por análisis filogenético usando la secuencia del gen E de 12 cepas del virus. Para el análisis se utilizaron datos sobre predominancia delos serotipos obtenidos en estudios previos y datos oficiales de incidencia del dengue.

Resultados. Los virus seleccionados se agruparon en el genotipo V junto a (DENV-1) de países de Latinoamérica y se evidenció segregación en cuatro linajes. Los cambios en la predominancia del virus coincidieron con el reemplazo de linaje y esto, a su vez, con incremento en la prevalencia de DENV-2y DENV-3, e incremento del dengue grave.

Conclusión. La diversificación genética podría contribuir a cambios de predominancia de (DENV-1), y la relación del virus con el DENV-2 y DENV-3 en situaciones que favorecen la presentación de casos graves. Se necesitan más estudios para precisar el papel de los serotipos en la epidemiología del dengue.

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Caracterización molecular de serovariedades de Leptospira spp. aisladas de muestras de animales y agua en Colombia

Resumen

Introducción. La leptospirosis es una infección bacteriana transmitida directa o indirectamente de animales a humanos, la cual puede resultar en una enfermedad hemorrágica grave, hepática o renal y pulmonar. Hay 20 especies de Leptospira conocidas y cientos de serovariedades, algunas de las cuales pertenecen a diferentes especies. Es esencial identificar las serovariedades patógenas y sus reservorios potenciales para enfocar estrategias de control.

Objetivo. Caracterizar las serovariedades de Leptospira aisladas de muestras de roedores, perros, cerdos y agua en Colombia.

Materiales y métodos. Las cepas de leptospiras aisladas fueron identificadas como patógenas usando la reacción en cadena de la polimerasa (PRC). Sus ADN y el ADN deSalmonella Braenderup H9812 (marcador de peso molecular) fueron cortados con NotI y corridos en electroforesis de campo pulsado. Los patrones de la ECP se analizaron con base en los criterios de tipificación para cepas bacterianas y el coeficiente de Dice, cuando se compararon con 200 cepas aisladas en otras partes del mundo. Los perfiles de ADN con un coeficiente de Dice entre 73,7 % y 100 % se consideraron pertenecientes a la misma especie.

Resultados. Todos los aislamientos fueron cepas patógenas y cinco se caracterizaron genéticamente. El aislamiento P275 (coeficiente de Dice: 84 %) y el P282 (coeficiente de Dice: 95 %) de cerdos, se relacionaron con Leptospira interrogans de serovariedad Pomona; el aislamiento de rata (I15) fue indistinguible de Leptospira interrogans de serovariedades Icterohaemorrhagiae o Copenhageni (coeficiente de Dice: 100 %), mientras que los aislamientos de perro (C67) y agua (A42) no se relacionaron (coeficiente de Dice <73,7 %) con ninguna de las 200 cepas de referencia; las más cercanas fueron Leptospira noguchii de serovariedades Nicaragua (coeficiente de Dice: 63 %) y Orleans (coeficiente de Dice: 60 %).

Conclusiones. Esta fue la primera caracterización molecular de serotipos de aislamientos colombianos, los cuales serían los primeros miembros de un panel diagnóstico colombiano.

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