IDENTIFICACIÓN DE ELEMENTOS cis-REGULATORIOS Y PREDICCIÓN BIOINFORMÁTICA DE FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN INVOLUCRADOS EN LA REGULACIÓN DE miARNs EN PLANTAS

RESUMEN

Los microARNs (miARNs) son pequeños ARN no codificantes que juegan un papel importante en el control de la expresión génica a través de la degradación de ARNm complementarios a su secuencia. La expresión de los miARNs es dependiente de la ARN polimerasa II como la mayoría de genes que codifican para proteínas. La regulación de  la expresión de miARNs está bajo el control coordinado y combinatorio de factores de transcripción (FT). En este trabajo, se realizó una aproximación bioinformática para identificar sitios de unión de FT, TFBS (del inglés Transcription Factors Binding Sites) en regiones promotoras de genes miRNAs en 17 especies vegetales y se analizó el papel de algunos FTendefensa contrabacterias. Se encontróquenuevede lasplantas analizadas presentaban diferencias significativas entre la distribución de TFBS presentes en los promotores de los miRNAs cuando se compara con los presentes en los genes codificantes de proteínas. En varios de los promotores de los miRNAs de yuca que son inducidos en respuesta a la infección por la bacteria Xanthomonas axonopodis pv. manihotis se identificaron elementos de unión como CCA1, T-box y SORLREP3, los cuales se presentan tambiénenlos genesque codifican proteínas implicadas enrespuestas al ciclo circadiano y a la luz,sugiriendo que estos procesos y las respuestas inmunes en plantas pueden ser coordinados. En conjunto este trabajo aporta luces sobre los posibles mecanismos transcripcionales del control de la expresión génica de los miARNs.

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XII Congreso Interamericano de Microscopía (CIASEM 2013)

 El Comité Interamericano de Sociedades de Microscopía (CIASEM) y la Asociación Colombiana de Microscopía (ASOCM) se complacen en invitarlos a participar en el próximo encuentro bianual en Colombia, al XII Congreso Interamericano de Microscopía (CIASEM 2013).

CIASEM es una organización regional inscrita de la Federación Internacional de Sociedades de Microscopía (IFSM).

Cada dos años se encarga de organizar el Congreso Inter-americano de Microscopía, que en esta oportunidad se llevará a cabo en la ciudad de Cartagena de Indias, Colombia. 

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20 becas de doctorado en biología

El International PhD Program in the Biological Sciences del Max Planck Institute for Developmental Biology y el Friedrich Miescher Laboratory en Tübingen ofrece 20 becas de doctorado. Fecha de cierre: 15 de septiembre de 2013. Mayor información.

Evento que busca socializar las actividades y resultados de investigación y desarrollo en biología computacional y áreas afines, en el ámbito Colombiano, como base para promover la identificación y desarrollo de proyectos nacionales con posible colaboración e impacto internacional.

Horario: del 25 al 27 de septiembre del 2013.

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Mosquitos transgénicos para combatir la epidemia de dengue

Dos son las necesidades básicas de todo animal: saciar el hambre y reproducirse. Si lo primero está en la base de los picotazos que las hembras del mosquito Aedes aegypt propinan a los humanos para obtener su sangre —proceso durante el cual le inoculan el virus del dengue—, lo segundo es la base de la última de las soluciones que se ensayan para frenar la enfermedad.

Después de algunos intentos a menor escala, Brasil lidera la idea: se trata de soltar machos modificados genéticamente para tener crías no viables. Con eso, sacian el afán reproductor de la hembra, y se espera reducir la población de insectos. En esta línea, la ciudad de Juazeiro en el interior del Estado de Bahía, se ha convertido en el primer laboratorio en el que las autoridades sanitarias han asumido el reto de reducir la incidencia del dengue a través de la liberación de millones de mosquitos transgénicos. Allí se inauguró el 7 de julio la primera biofábrica de la Organización Social Moscamed,donde se crían semanalmente medio millón de Aedes aegypt genéticamente modificados. En la misma ciudad, perdida en el campo del noreste brasileño y conocida por ser donde nació el legendario maestro de la bossa nova Joao Gilberto, investigadores de Moscamed han soltado cada semana miles de insectos con el objetivo de frenar el avance de una de las epidemias que más preocupan anualmente al Gobierno.

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Descifran la maquinaria de ataque de las bacterias

Descifran la maquinaria de ataque de las bacterias

Publicado en la revista ‘Nature Chemical Biology’, este descubrimiento ofrece nuevas pistas sobre la lucha contra los patógenos que son cada vez más resistentes a los antibióticos. Para atacar a la célula huésped, el arma debe primero conectar. El mecanismo del agresor es compuesto de siete proteínas que se pliegan sobre sí y se ensamblan en un anillo y estas largas moléculas, con el tiempo, se desarrollan para formar una especie de espolón.

El disparador es sólo otra parte de la máquina, un péptido, o una pequeña molécula orgánica, que cuando se expone a las enzimas del organismo huésped, se separa. El balance de la unión se ajusta: las proteínas adoptan una nueva forma, que tiende a un movimiento circular para formar un espolón, que luego atraviesa la membrana de la célula huésped.

Ninguna reacción química está involucrada en este tipo de armas biológicas, sino que se trata de un fenómeno mecánico, aunque a nivel molecular. Matteo Dal Peraro, coautor de este estudio, también utiliza el término “nano máquina” para referirse a esta herramienta de agresión bacteriana.

Los investigadores de la EPFL han trabajado en cepas de ‘Aeromonas hydrophila’, una bacteria bien conocida entre los viajeros por los trastornos intestinales que causa. En placas de Petri, los investigadores lograron intencionadamente causar la formación de estos dardos, exponiendo de este modo los microorganismos a las enzimas digestivas, y fueron capaces de modelar con precisión cómo cada proteína se reordena de forma dinámica, una vez que el péptido no está, para formar el espolón.

Para otro de los autores, Gisou Van der Goot, este descubrimiento abre nuevas perspectivas terapéuticas, por ejemplo en los casos de infección por estafilococos nosocomiales. “Podríamos imaginar catéteres recubiertos con péptidos de sustitución -dice–. “Se podría prevenir la formación del anillo y, por lo tanto, el espolón. 
Queremos evitar muchas infecciones en los hospitales”.

La idea es abordar el armamento de las bacterias en lugar de la propia bacteria, algo particularmente atractivo en un momento en el que múltiples resistencias a los antibióticos se están volviendo cada vez más comunes. “Este enfoque tendría la ventaja de no causar mutaciones, y con ello, la resistencia de bacterias patógenas”, concluye el investigador.

Links de interes:
 
http://www.europapress.es/salud/noticia-descifran-maquinaria-ataque-bacterias-20130804190815.html
http://phys.org/news/2013-08-nano-machine-cell-killer-team-deciphers.html

Epigenética: definición, bases moleculares e implicaciones en la salud y la evolución humana.

Resumen

La Epigenética se refiere a los cambios heredables en el ADN e histonas que no implican alteraciones en la secuencia de nucleótidos y modifican la estructura y condensación de la cromatina, por lo que afectan la expresión génica y el fenotipo. Las modificaciones epigenéticas son metilación del ADN y modificaciones de histonas. Objetivo: hacer una revisión de la literatura sobre el  concepto de epigenética y su impacto en la salud. Materiales y métodos: se realizó una revisión  de la bibliografía sobre el concepto de epigenética, sus bases biológicas, el impacto sobre la salud  y la enfermedad y su relación con la evolución. Resultados: los mecanismos epigenéticos han  cobrado cada vez más importancia debido a la creciente asociación con enfermedades complejas  y comunes, así como por su impacto en la salud de generaciones futuras y en la evolución humana. Conclusiones: la Epigenética tiene un claro impacto en la salud del individuo, en la de su  descendencia y en la evolución de la especie humana.

Palabras clave: procesos epigenéticos, metilación del ADN, histonas, evolución biológica.

Introducción

Concepto

El término Epigenética fue acuñado en la década del cincuenta para describir el mecanismo  por el cual los organismos multicelulares desarrollan múltiples tejidos diferentes a partir de  un único genoma. En la actualidad reconocemos  que este proceso se logra mediante marcas moleculares detectables; dichas marcas generan  modificaciones que afectan la actividad transcripcional de los genes y una vez establecidas son relativamente estables en las siguientes  generaciones (1).El uso actual del término  consiste en indicar cambios heredables en la estructura y organización del ADN que no involucran cambios en la secuencia y que modulan la expresión génica. Estos cambios en la  expresión génica implican, entonces, cambios heredables en el fenotipo (1-3). Los mecanismos tradicionales de regulación epigenética  incluyen metilación del ADN y modificaciones de histonas, entendiendo a estas proteínas  como las encargadas de empaquetar el ADN y  considerando que los dos tipos de mecanismos participan en la modulación de los complejos remodeladores de la cromatina (1-2). En esta  revisión abordaremos los mecanismos tradicionales de la regulación epigenética descritos anteriormente (2).

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