PROGRAMA NACIONAL DE BIOTECNOLOGIA COLCIENCIAS

El Programa Nacional de Biotecnología reúne las capacidades de investigación e innovación de universidades, centros de investigación y empresas con el propósito de articularlos entre sí y con las entidades del Estado, para contribuir al incremento del desarrollo, el bienestar y la competitividad económica de Colombia, a partir del conocimiento, protección y aprovechamiento de la biodiversidad.

Líneas de Acción:

- Consolidación de la industria biotecnológica en Colombia

- Desarrollo y producción de biocombustibles renovables y ambientalmente sostenibles

- Conocimiento, protección y aprovechamiento sostenible de la biodiversidad

Plan Estratégico:

De acuerdo con los objetivos y estrategias definidos en la Política Nacional de Ciencia, Tecnología e Innovación, el Programa Nacional de Biotecnología busca, entre otros lineamientos:

- Promover la creación y el desarrollo de consorcios empresariales y de empresas biotecnológicas en áreas estratégicas

- Incentivar la protección de la propiedad intelectual

- Impulsar las iniciativas legales tendientes a conformar un marco regulatorio coherente y transparente que favorezca el desarrollo de la biotecnología

- Desarrollar iniciativas regulatorias urgentes y necesarias para lograr el despegue del esfuerzo nacional en biotecnología y bioseguridad

- Incrementar los RR.HH. dedicados a la I+D y gestión biotecnológica en áreas estratégicas

- Establecer nuevas modalidades de financiamiento para la I+D en biotecnología

- Promover la institucionalidad para la coordinación pública y la participación ciudadana

- Desarrollar y desplegar instrumentos de promoción del sector biotecnológico empresarial

- Gestionar la creación de nuevos centros de biotecnología moderna

Proyectos Especiales:

Centro Nacional de Secuenciación Genómica

Siguiendo un proceso de diagnóstico de las capacidades y necesidades en infraestructura para investigación en genómica en el país, se estableció la importancia para que Colombia cuente con equipos actualizados en genómica que permitan adelantar estudios de nuestra biodiversidad. Con el propósito de ofrecerle al Sistema Nacional de Ciencia, Tecnología e Innovación esta capacidad, se ha suscrito un convenio especial de cooperación entre Colciencias, Roche y la Universidad de Antioquia. El Centro Nacional de Secuenciación Genómica (CNSG) entrará en operación en septiembre de 2010, y prestará sus servicios, de manera independiente, a universidades, centros y empresas que los requieran.

Centro de Bioinformática y Biología Computacional

Se ha determinado la necesidad de un centro de manejo y análisis de datos de investigación biológica (incluidos los de genómica) con infraestructura computacional robusta, que se convierta en centro de referencia en biocomputación para América Latina. Este proyecto hace parte de un convenio especial de cooperación entre Colciencias, el Ministerio de TIC y Microsoft; se espera que el Centro entre en operación a finales de este año. La conformación y administración de este Centro de servicios informáticos la lideran las redes SUMA y Alma Mater, en el Eje Cafetero.

Contactos: 

contacto@colciencias.gov.co

Mauricio Rodríguez Rodríguez, Ph.D., Gestor del Programa Nacional de Biotecnología

Adriana Gisela Rosillo, MS., Asesora

Mariana Delgado, Profesional

Julieth Rivera, Joven Investigadora

Patricia Contreras

Simón Buriticá

Bioinformatic Analysis Group - GABi

El Grupo de Análisis de Bioinformática - Gabi fue creado en 2007 con el objetivo de realizar investigación en bioinformática en Colombia. Somos parte del Centro de Investigación y Desarrollo en Biotecnología - CIDBIO.

Gabi es institucionalmente dependiendo de CIDBIO y nuestro modelo de trabajo es, básicamente, virtual, pero el lugar físico del grupo es en Bogotá DC, Colombia.

Adicionalmente a la investigación en bioinformática, Gabi se centra en cuestiones de educación y capacitación con el fin de:

• Fortalecer las competencias profesionales en los enfoques bioinformáticas de biólogos, bioquímicos, genetistas, químicos, biólogos moleculares
• Darles una adequeated asesorar en los procedimientos bioinformáticos para ayudar a sus investigaciones.

Común rutinas bioinformáticas como predicción de la estructura, secuencia, de dominio, y caracterización de proteínas con motivos son bien conocidos en nuestro grupo. Estamos también se centró en los métodos de filogenia, la genómica comparativa para inferir la funcionalidad y la extracción de datos para construir el conocimiento biológico. Además, el grupo se encuentra en continuo crecimiento gracias a diferentes proyectos de bioinformática en curso. Estos proyectos están involucrados en la predicción de la interacción de proteínas complejas, la función de predicción de genes, genes / proteínas de redes, y caracterización de nuevos dominios conservados funcional.

Objetivos del grupo

• Llevar a cabo proyectos de investigación de la participación en temas científicos descritos en el backgorund grupo.
• Diseñar y aplicar de estrategias biotecnológicas para resolver problemas comunes en nuestra sociedad.
• Colaborar en proyectos de investigación interinstitucionales que involucran temas principales que se describen en el perfil de grupo.
• Promover reuniones científicas y la bioinformática en Colombia.
• Desarrollar la bioinformática adequeated aprendizaje programes para dar apoyo en los campos comunes en la investigación científica.

www.gabi.cidbio.org

La bioinformática crece en Colombia

Bogotá D.C., mar. 18 de 2011 - Agencia de Noticias UN

Durante tres días, expertos de Colombia y el mundo analizarán las perspectivas de desarrollo de la biología computacional y revisaran sus principales aplicaciones.

La anotación del genoma humano se logró en gran parte gracias a las ciencias de la informática. Estos progresos generan una gran cantidad de datos cuyo análisis demanda el uso de herramientas computacionales altamente especializadas. El desarrollo de estas herramientas tiene por nombre bioinformática.

Con el uso de la biología computacional ha sido posible empezar la anotación de los genomas y la elaboración de mapas genéticos y físicos cada vez más complejos, incluyendo genomas de organismos no celulares. Pero es aquí donde se hace más necesaria la bioinformática, con la cual se pueden transformar esos datos en información útil que permita el desarrollo de nuevas tecnologías para la elaboración de medicamentos, pruebas de paternidad, alimentos y nuevos avances en la curación de enfermedades, entre otros usos.

El desarrollo de esta ciencia en Colombia comenzó hace diez años a partir de cursos de formación. Desde entonces, en el país se ha avanzado no solo en el número de personas que la usan, sino en la aparición de investigadores con formación de doctorado que hacen desarrollos interesantes y competitivos en biología computacional.

“Hace diez años, los sistemas de investigación en biología eran difíciles de utilizar porque era muy costoso el equipo. Ahora las técnicas están disponibles a costos muy bajos que permiten que con los presupuestos que tenemos se puedan acceder a las técnicas o contratarlas tanto en Colombia como en el extranjero y recibir los datos. Vamos a tener una masa muy grande de datos y una necesidad creciente de crear herramientas para implementarlas y aprovecharlas para sacar la mayor información de los experimentos que hacemos”, comentó Emiliano Barreto, director del Centro de Bioinformática de la UN en Bogotá.

Hay centros especializados a nivel mundial en mantener y desarrollar ese tipo de herramientas. Por ejemplo, en Estados Unidos existe el Centro Nacional de Información para la Biotecnología, que cuenta con la base de datos de todas las secuencias de ADN que los investigadores han querido reportar en el mundo. Esa base de datos tiene 300 millones de secuencias y está disponible y preservada para que cualquier persona en el mundo pueda consultar la base de datos.

La bioinformática en la UN

“En el 2001 creamos los primeros cursos permanentes a nivel de posgrado, hay algunos cursos en el Instituto de Biotecnología y en las facultades de Ciencias e Ingeniería que han manejado algunos proyectos específicos, lo cual nos ha permitido tener estudiantes de maestría haciendo trabajos de investigación y estudiantes de pregrado que hacen sus trabajos finales en bioinformática. En la actualidad se propuso la creación de una maestría en biología computacional”, explicó Barreto.

El congreso comenzará el 23 de marzo y vendrán invitados especiales de Estados Unidos, Europa y Chile. El evento se realizará en la Biblioteca Virgilio Barco y cuenta con la coordinación de la Universidad Nacional, la Universidad de Los Andes y la colaboración de más de diez instituciones de todo el país.

Informes en el 316 5000, extensión 16956, correo electrónico ebarretoh@unal.edu.co.

N° 346

www.agenciadenoticias.unal.edu.co

Grupo de Bioinformatica en Colombia - Facebook

Bioinformática, biología computacional, biología de sistemas y afines. Cuantas personas en Colombia hacen bioinformática? Que tan desarrollada está la bioinfomática en el país? cuales son los principales temas que se están desarrollando? Que Universidades tienen mas experiencia? Que tan complicado es encontrar financiación para desarrollar proyecto de bioinformática? Dirigido a colombiano(a)s que trabajen en el [...]

EMBnet Colombia

EMBnet Colombia es el nodo Colombiano de la Red Europea de Biología Molecular (Embnet), una red mundial de centros en bioinformática con nodos en los 5 continentes. EMBnet Colombia se encuentra a cargo del Centro de Bioinformática del Instituto de Biotecnología (CBIB) de la Universidad Nacional de Colombia.

Centro de Investigación y Desarrollo en Biotecnología

La Misión

El Centro de Investigación y Desarrollo en Biotecnología promueve e impulsa la investigación científica en Colombia desarrollando e implementando herramientas biotecnológicas cuya finalidad son: la creación de productos nacionales de uso en la investigación, así como también la formación, la asesoría y producción científicas.

La Visión

El Centro de Investigación y Desarrollo en Biotecnología se proyecta sobre una sólida base de formación científica para lograr convertirse en una empresa de impacto nacional en lo que se refiere al desarrollo y aplicación de productos biotecnológicos para uso en la investigación. Gracias a su constante retroalimentación y capacidad científica también logrará posicionarse como eje central del progreso científico para pequeños y medianos grupos científicos nacionales contribuyendo en la directa generación y transferencia de tecnologías aplicables a nuestra sociedad.

Objetivos

General

•Impulsar la investigación y el desarrollo biotecnológicos en Colombia.
Específicos

1.Desarrollar productos biotecnológicos nacionales de uso en la investigación científica con el fin fomentar la creación y el crecimiento de grupos de investigación nacionales.
2.Brindar asesoría en la investigación científica a pequeños y medianos grupos de investigación en Colombia.
3.Generar proyectos de investigación científica en las áreas de estudio descritas en el marco funcional de la institución.
4.Diseñar y aplicar nuevas estrategias biotecnológicas a la resolución de problemas de interés científico de nuestra sociedad.
5.Colaborar en proyectos, interinstitucionales, de investigación que involucren las áreas de estudio descritas en el marco funcional de la institución.
6.Participar en la realización de eventos que tengan como fin la promoción y el avance científicos a nivel nacional.
7.Formar y capacitar a personal en el que hacer de la investigación científica.

Área Curricular en Biotecnología – Universidad Nacional

La gran diversidad biótica y climática de Colombia junto con la heterogeneidad socio-económica de su población; le confiere un gran potencial tecno-científico para enfrentar las diferentes problemáticas y oportunidades inherentes a su dinámica interna y a la globalización. Una de áreas que mas alternativas de progreso le ofrece a nuestro país es la biotecnología y su incorporación al sector productivo, lo posicionará adecuadamente en el contexto internacional. Con esta visión Colombia creó el Programa Nacional de Biotecnología y, declaró esta área de conocimiento como estratégica para su desarrollo. Siguiendo esta línea de pensamiento, la Universidad Nacional de Colombia Sede Medellín, se dio a la tarea de fortalecer su capacidad física y talento humano en este campo, y como resultado creó los programas curriculares de Especialización y Maestría en Biotecnología (Acuerdo N° 16 del Consejo Académico, acta N° 7 de noviembre 12 de 1997), el programa de pregrado de Ingeniería Biológica (Acuerdo 18 de 2001 del Consejo Académico) y en proceso de aprobación el Doctorado en Biotecnología. Programas Curriculares El Área Curricular en Biotecnología ofrece cuatro programas curriculares. Ingeniería Biológica (Pregrado), Especialización en Biotecnología, Maestría en Ciencias – Biotecnología y el Doctorado en Biotecnología. Los títulos que otorgan estos programas son: Ingeniero(a) Biológico(a), Especialista en Biotecnología, Magíster en Ciencias – Biotecnología y Doctor en Biotecnología. Objetivos – Formar profesionales capacitados para innovar o desarrollar nuevos procesos y tecnologías de producción en el área de los bioprocesos. – Implementar técnicas biotecnológicas, identificar problemas, formular hipótesis y sugerir soluciones posibles mediante el uso de la biotecnología. – Formar Investigadores y especialistas con conocimientos científicos y tecnológicos de actualidad en diferentes campos de la biotecnología, que le permitan contribuir al desarrollo del país, en los campos de la biotecnología animal, vegetal, microbiana e industrial. Perfil Profesional Las personas que egresan del Área Curricular en Biotecnología están capacitadas para desempeñarse en Docencia, en Investigación y en procesos biotecnológicos (teórica, aplicada) y en el desarrollo de Proyectos InterdisciplinariosDependiendo de la línea de investigación o de formación desarrollada, la persona egresada estará capacitada para desempeñarse en procesos biológicos a diferentes niveles, en las áreas ambiental, alimentos, biología molecular, biocombustibles , bebidas alcohólicas, enzimas, antibióticos, biorremediación, cosmética, farmacológica y genética, entre otras. Además participar en investigación inter y transdisciplinar. Duración La duración promedia establecida para cursar y culminar con éxito todos los niveles de cada programa es:- Ingeniería Biológica: Diez (10) períodos académicos. – Especialización en Biotecnología: Dos (2) períodos académicos. – Maestría en Ciencias – Biotecnología: Cuatro (4) períodos académicos. – Doctorado en Biotecnología: Ocho (8) períodos académicos.

Tomado de http://www2.unalmed.edu.co/~facciencias/index.php?option=com_content&view=article&id=109&Itemid=81

Ingeniería Biológica – Medellin – Universidad Nacional de Colombia

OBJETIVO GENERAL

Formar profesionales idóneos con sólida formación en ciencias exactas y naturales, con capacidad para desarrollar y conducir procesos biológicos en condiciones de competitividad económica y sostenibilidad ambiental, para contribuir al desarrollo nacional.
OBJETIVOS ESPECÍFICOS

Desarrollar destrezas y habilidades para la formulación, realización y evaluación de proyectos en el campo de los procesos biológicos.
Desarrollar capacidades para la participación activa en el trabajo interdisciplinario en los sectores académico e industrial, requisito indispensable en el área de los procesos biológicos.
Proporcionar una sólida formación básica integral a sus egresados, requerida para continuar estudios de posgrado en áreas propias o afines al campo de los procesos biológicos.

ESTRUCTURA DEL PLAN DE ESTUDIOS

De acuerdo con los lineamientos establecidos en el acuerdo 14, de septiembre de 1990 del Consejo Académico, las asignaturas de núcleo básico representan el 75% del Programa y el componente flexible el 25%.
PLAN DE ESTUDIOS

PRIMER SEMESTRE
Matemáticas I
Química
Geometría
Seminario de Inducción
Contexto I
Introducción a la Ingeniería Biológica
SEGUNDO SEMESTRE
Matemáticas II
Álgebra Lineal
Química II
Biorgánica
TERCER SEMESTRE
Matemáticas III
Biología Celular
Física II
Bioquímica
Bioestadística
CUARTO SEMESTRE
Ecuaciones Diferenciales
Métodos básicos en Biología Celular
Física III
Diseño de Experimentos
Biología Molecular
QUINTO SEMESTRE
Métodos Numéricos
Microbiología
Balance de Materia y Energía
Ecología
Genética

SEXTO SEMESTRE
Biofísica
Cultivos Celulares
Tecnología Enzimatica
Fenómenos de Transporte
Contexto II
SÉPTIMO SEMESTRE
Biotermodinámica
Diseño de Bioreactores
Ing. Procesos Biológicos I
Ingeniería Genética
Contexto III
OCTAVO SEMESTRE
Ingeniería Bioquímica
Ing. Procesos Biológicos II
Control de Bioprocesos
Electiva I
Profundización I
NOVENO SEMESTRE
Lab. Ing. Bioprocesos I
Ing. Procesos Biológicos III
Electiva II
Electiva III
Profundización
T.D.G. I
DÉCIMO SEMESTRE
Lab. Ing. Bioprocesos II
Evaluación de Proyectos
Profundización III
Bioética
T.D.G. II
HISTORIA REGLAMENTARIA

1. Crea el programa de pregrado de Ingeniería Biológica Acuerdo N° 18 de 2001 C.A.
2. Autoriza la apertura del programa de pregrado de Ingeniería Biológica Acuerdo N° 19 de 2001 C.A.

Grupo de Biología Molecular de la Universidad Distrital Francisco Jose De Caldas

¿QUIENES SOMOS?

El grupo de Biología Molecular Tiene varios frentes de trabajo, que se Relacionan con el desarrollo Investigaciones, productos y servicio Altamente Calificados. Las Líneas de investigación que Actualmente se desarrollan son:

Nombre de la Línea: BIOLOGÍA MOLECULAR DE AGENTES INFECCIOSOS
Objetivo de la Línea
El estudio de enfermedades infecciosas y genéticas de importancia en salud pública. Se han desarrollado trabajos en Tuberculosis considerada hoy como la principal causa de mortalidad en el mundo, particularmente en países tropicales y en vía de desarrollo. La resistencia de mycobacterium tubercuosisi a los antimicrobianos ha tenido un gran aumento en el mundo y en colombia debido entre otros a terapias inadecudas. Es por esto surge el interés del grupo en encontrar fragmentos y asociaciones entre mutaciones que confieran resistencia a los antimicrobianos para ser utilizado diagnostico. Recientemente se ha ampliado el campo de acción hacia enfermedades infecciosas y genéticas como la toxoplasmosis la Hepatitis B y en el campo de genética molecular la detección de mutaciones en cromosomas. También se han iniciado investigaciones diseño de Péptidos como métodos de diagnostico en toxoplasmosis, hepatitis B.

Logros de la Línea: Publicación de libros, Resultados de investigación, además reporte de cepas resistentes a rifampicina para la ciudad de Bogota, participación en Identificación de mutaciones en el CORE de HBV así como la tipificación de cepas de toxoplasma gondi por medio de Pépticos. Efectos de la Línea Desarrollo de planes y programas para la prevención primaria y control de la tuberculosis multiresistente. Desarrollo de planes y programas para la prevención primaria y control de HBV y T. gondi.

Nombre de la Línea: CARACTERIZACIÓN Y CONSERVACIÓN GENÉTICA DE AVES ENDÉMICAS EN PELIGRO DE EXTINCIÓN
Objetivo de la Línea: El objetivo de esta investigación es la obtención de datos a nivel genético bioquímica y molecular en una serie de aves de la sabana de Bogotá con el propósito de analizar e implementar marcadores genético de diferente naturaleza que se puedan ser usados en futuros inventarios y caracterización de aves endémicas. mediante análisis y secuenciación de DNAmt( Citb,Dloops, COII).
Esta línea también busca responder a preguntas como de interés taxonómico como lo son estudios sobre inferencia filogenético y Biogeográfica en eventos de especiacion y colonización de aves en la sabana de Bogota.
Participación como investigador principal para el proyecto de conocimiento y conservación de la tingua moteada Gallinula melanops mediante la implementación de marcadores moleculares. convenio Institucional-CAR/UD
Efectos de la Línea: Manejo consecución de muestras biológicas y Genéticas. Ejecución de planes y programas de conservación de especies endémicas amenazadas en riesgo critico de Extincion.consecion de permiso para investigación con recurso génico a partir del recurso biológico in situ ante el Ministerio de Ambiente Vivienda y desarrollo territorial.


Nombre de la Línea: BIOINFORMÁTICA Y GEONÓMICA FUNCIONAL
Dado el desarrollo de la Bioinformática y la Creciente dependencia que de ésta tienen todos los investigadores que manejan datos biológicos, es importante familiarizarlos con las herramientas disponibles a sus alcances.
Debido a esto el grupo tiene en marcha una línea de profundización y de actualización con respecto a los temas y aplicaciones directas que se deriven de la genómica y de la bioinformática en el ámbito científico.
Se esta implementando un modelo de programación con el fin de analizar grupos de datos biológicos con las principales herramientas bioinformáticas, que involucren el análisis y predicción de secuencias, su estructura y función.

Nombre de la Línea: CARACTERIZACIÓN Y CONSERVACIÓN DE MAMIFEROS

Objetivo de la Línea: El objetivo de esta investigación es la obtención de datos a nivel genético bioquímica y molecular en una serie de mamiferos con el propósito de analizar e implementar marcadores genético de diferente naturaleza que se puedan ser usados en futuros inventarios y caracterización de mamiferos. mediante análisis y secuenciación de DNAmt( Citb,Dloops, COII).

Esta línea también busca responder a preguntas como de interés taxonómico como lo son estudios sobre inferencia filogenético y Biogeográfica en eventos de especiacion y colonización de mamiferos en Colombia .

Nombre de la Línea: ENTOMOLOGIA FORENSE
Objetivo de la Línea: Generar herramientas con soporte cientifico para la determinacion del intervalo pos-morten y la correcta diferenciacion de los individuos de interes forense tanto morfologica como molecularmente.

PONENCIAS NACIONALES

• Ponencia del trabajo “Aspectos anatómicos de los estadios larvales de la mosca verde, Lucilia sericata (díptera; Calliphoridae) en especimenes criados en laboratorio” en el XII Seminario de Investigaciones Biológicas realizado en la Universidad Distrital Francisco José de Caldas. Por parte del licenciado en Biología Oscar Rodriguez en Bogotá 9 y 10 de Noviembre de 2006.
• Ponencia en el XXXII Congreso de la Sociedad Colombiana de Entomología con el trabajo titilado: ASPECTOS ANATOMICOS DE LOS ESTADIOS LARVALES DE LA MOSCA VERDE, Lucilia sericata (Meigen) (Díptera: Calliphoridae), EN ESPECIMENES CRIADOS EN LABORATORIO EN BOGOTA COLOMBIA. Por los licenciados en Biología, Oscar Rodríguez y Sergio Arango en Ibagué 27, 28 y 29 de julio 2005.
  
• Ponencia en el XXXII Congreso de la Sociedad Colombiana de Entomología con el trabajo titilado: ASPECTOS MORFOLOGICOS DE LOS ADULTOS DE LA MOSCA VERDE, Lucilia sericata (Meigen) (Díptera: Calliphoridae), EN ESPECIMENES CRIADOS EN LABORATORIO EN BOGOTA COLOMBIA. Por los licenciados en Biología, Sergio Arango y Oscar Rodríguez en Ibagué 27, 28 y 29 de julio 2005.
  
• Ponencia en el XXXII Congreso de la Sociedad Colombiana de Entomología con el trabajo titilado: DINAMICA DE LOS CALLIPHORIDAE (Diptera) EN EL PROCESO DE DESCOMPOSICION EN UN CERDP BLANCO, Sus Scrofa, EN LA MESA, CUNDINAMARCA. Por el estudiante en Biología, Milton Ariza Leon en Ibagué 27, 28 y 29 de julio 2005.

INTERNACIONALES

• Ponencia del trabajo de grado titulado “CICLO DE VIDA Y CURVAS DE CRECIMIENTO DE Lucilia sericata (DIPTERA: CALLIPHORIDAE) EN LABORATORIO Y EN DOS ZONAS CLIMATICAS CONTRASTANTES (SECA Y SUB HUMEDA) DE LA SABANA DE BOGOTA”, en el III meeting europeo de entomología forense (EAFE), realizado en Italia. Bari 26, 27, 28 y 29 Abril 2006.
• Ponencia del trabajo de grado titulado “DINAMICA DE LA COMUNIDAD DE DIPTEROS SARCOSAPROFAGOS EN UN CAVERNA DE LA REGION CENTRAL DE COLOMBIA”
• Expuesto por la Doctora en Ciencias Biológicas de la Universidad de Murcia, España; Maria Isabel Arnaldos.

NOMINACIONES

• Nominado al premio nacional Francisco Luís Gallego al mejor trabajo de pregrado en la categoría de taxonomia y ecología en el XXXII Congreso de la Sociedad Colombiana de Entomología a los estudiantes Sergio Arango y Oscar Rodríguez - Ibagué 27, 28 y 29 de julio 2005.

POSTERS, INTERNACIONAL

• “DINAMICA DE LA COMUNIDAD DE DIPTEROS SARCOSAPROFAGOS EN UN CAVERNA DE LA REGION CENTRAL DE COLOMBIA”
• “CICLO DE VIDA Y CURVAS DE CRECIMIENTO DE Lucilia sericata (DIPTERA: CALLIPHORIDAE) EN LABORATORIO Y EN DOS ZONAS CLIMATICAS CONTRASTANTES (SECA Y SUB HUMEDA) DE LA SABANA DE BOGOTA”.
  
• En el III meeting europeo de entomología forense (EAFE), realizado en Italia. Bari 26, 27, 28 y 29 Abril 2006.

EVENTOS REALIZADOS

• Seminario Taller: Introducción a la Entomología Forense. En el Marco de la II Semana de la Biología, Biodiversidad y Conservación - Universidad Distrital Francisco José de Caldas; Mayo de 2004.
• Curso internacional de entomología forense - Universidad Distrital Francisco José de Caldas; Octubre 10 al 14 de 2005.

EFECTOS DE LA LINEA: Adquirir herramientas con soporte cientifico para la determinacion del intervalo pos-morten y la correcta diferenciacion de los individuos de interes forense morfologica y molecularmente.

Proyectos Institucionales & Semilleros de Investigación

Institucionales

• CONTRIBUCIÓN AL CONOCIMIENTO Y CONSERVACIÓN DE LA POLLA SABANERA Gallinula melanops bogotensis (AVES: RALLIDAE) MEDIANTE LA UTILIZACIÓN DE UN SEGMENTO DEL GEN DE CITOCROMO B DEL mtDNA EN POBLACIONES DE LAS LAGUNAS DE FÚQUENE, LA HERRERA Y EL SALITRE.
• DISTRIBUCIÓN, ASPECTOS ECOLÓGICOS Y ESTADO DE CONSERVACIÓN DEL RASCÓN BOGOTANO Rallus semiplumbeus (AVES: RALLIDAE) EN EL LAGO DE TOTA (BOYACÁ – COLOMBIA)
• ANALISIS MORFOLÓGICO, IMPLEMENTACION DE MARCADORES MICROSATELITALES Y SECUENCIA GENES MITOCONDRIALES NUCLEARES EN DOS POBLACIONES DE Cuniculus taczanowskii (Rodentia: Cuniculidae) DE LOS DEPARTAMENTOS DE ANTIOQUIA Y CUNDINAMARCA (COLOMBIA)
• APORTES AL ESTUDIO DE LA DIVERSIFICACIÓN MOLECULAR DE LAS SALAMANDRAS COLOMBIANAS DEL GENERO BOLITOGLOSSA (CAUDATA: PLETHODONTIDAE) Y SU DISTRIBUCIÓN BIOGEOGRÁFICA
• MARCADORES MOLECULARES PARA MUTANTES DE ARROZ (oryza sativa ) ASOCIADOS A RESISTENCIA AL VIRUS DE LA HOJA BLANCA.
  

PROYECTOS CON SEMILLEROS DE INVESTIGACIONPROYECTOS FINANCIADOS CIDC

• DETECCIÓN DEL VIRUS DE LA HEPATITIS B (HBV) POR MEDIO DE LA TÉCNICA HOT-PCR
• LA BRIOFLORA, (MUSGOS – HEPATICAS) DE LA MESA DE LOS SANTOS, SANTANDER COLOMBIA
• PERFIL DE INFERTILIDAD PARA EL DIAGNÓSTICO DE Chlamydia trachomatis, Mycoplasma hominis Y Ureaplasma urealyticum POR MEDIO DE LA TÉCNICA PCR-SSP
• APORTES AL ESTUDIO DE LA DIVERSIFICACIÓN MOLECULAR DE LAS SALAMANDRAS COLOMBIANAS DEL GENERO BOLITOGLOSSA (CAUDATA: PLETHODONTIDAE) Y SU DISTRIBUCIÓN BIOGEOGRÁFICA.

PROYECTOS FINANACIADOS GRUPO BIOLOGIA MOLECULAR

• REVISION DEL STATUS TAXONOMICO DE Pionites melanocephala (AVES: Psittacidae) MEDIANTE ESTUDIOS EN MARCADORES MOLECULARES DE DNAmt CITOCROMO B EN PIELES
• AMPLIFICACION DE LOS GENES SOX 8 Y 9 DEL GRUPO E EN Hyla boans (AMPHIBIA-HYLIDAE) Y SUS IMPLICACIONES EN LA DIFERENCIACION SEXUAL
• RELACIONES FILOGENÉTICAS DE TRES ESPECIES PERTENECIENTES AL GÉNERO Hapalopsittaca (AVES PSITTACIDAE) HABITANTES DE BOSQUES ALTOANDINOS COLOMBIANOS
• EVALUACIÓN FILOGENÉTICA Y DETERMINACIÓN DEL ORIGEN Y RELACIONES FILOGEOGRÁFICOS DE Ognorhynchus icterotis (AVES PSITTACIDAE) EN LOS BOSQUES ALTOANDINOS DE COLOMBIA.
• ESTUDIO DE MARCADORES MOLECULARES PARA LA REVISIÓN DE ESTADO TAXONOMICO DE Coeligena prunellei, EN PIELES DE COLECCIÓN.

Contacto

Teléfono: 3375130

Dirección: Calle 26a # 4B57

Correo electrónico: biomolc@gmail.comEsta dirección de correo electrónico está protegida contra los robots de spam, necesita tener Javascript activado para poder verla

biomolc@udistrital.edu.coEsta dirección de correo electrónico está protegida contra los robots de spam, necesita tener Javascript activado para poder verla

www.gemini.udistrital.edu.co

Centro de Bioinformática del Instituto de Biotecnología de la Universidad Nacional de Colombia

Bioinformática, conformada desde el año 1999 con visión interdisciplinaria, atesora la diversa y complementaria formación académica de integrantes vinculados a las Facultades de Ciencias e Ingeniería y el Instituto de Biotecnología. Nos dedicamos al desarrollo de la bioinformática como área de investigación, docencia y extensión, a través del manejo y análisis de datos, y la generación de información que facilita el desarrollo y avance del conocimiento en áreas como Genética, Biología molecular, Ingeniería genética y Biotecnología, entre otras.

Equipo interdisciplinario que desarrolla su actividad investigativa en tres grandes líneas: Salud, Biodiversidad y Desarrollo de herramientas bioinformáticas.

En Bioinformática y Salud, cuyo objetivo es contribuir a la obtención, almacenamiento y análisis de datos, producto de estudios moleculares para la clasificación y aprovechamiento de información biológica relacionada con el área de la salud, trabajos de investigación en la detección, comparación, búsqueda y análisis de secuencias codificantes de resistencia a antibióticos que están presentes en bacterias causantes de infecciones intrahospitalarias en Colombia; también uso de la minería de datos para la búsqueda de relaciones metabólicas entre genes diferencialmente expresados, y diseñamos y construimos sistemas para la identificación de posibles blancos proteicos, útiles en el desarrollo de vacunas, en enfermedades como la malaria.
En la línea Biodiversidad y Bioinformática, desarroll0 de trabajos en anfibios, en insectos , y en microbiología del suelo, para contribuir al conocimiento de la biodiversidad colombiana a través del desarrollo e implementación de sistemas bioinformáticos que permitan el almacenamiento, recuperación y análisis de datos moleculares, a partir de los cuales se desarrollen modelos de análisis que integren datos morfológicos, fisiológicos, bioquímicos y moleculares.
Dentro del campo de desarrollo de herramientas bioinformáticas, trabajamos en la Sequence Retrive System Federation en conjunto con otros cinco grupos a nivel de Europa y Latinoamérica. Adicionalmente, desarrollamos un sistema de identificación de sitios de unión de proteínas por métodos de aprendizaje de máquina, sistema con el que pretendemos desarrollar un modelo computacional para localizar sitios funcionales a partir de la estructura tridimensional de una proteína, iniciativa esta, que adelantamos en conjunto con el Laboratorio de Sistemas Inteligentes de la Facultad de Ingeniería de la Universidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá.
Como responsables del nodo colombiano de la Red Europea de Biología Molecular, EMBnet, a través del sitio web http://bioinf.ibun.unal-edu.co o http://co.embnet.org/ mantenemos y ofrecemos acceso a varias bases de datos públicos como UNIPROT y EMBL y a herramientas para el análisis de secuencias como EMBOSS, SEWER, DOTLET y TCoffee, entre otras. Así mismo proporcionamos acceso a herramientas desarrolladas por nosotros como el Sistema para consulta de colorantes de uso farmacéutico SINCO y la Base de datos con información molecular y taxonómica de la biodiversidad colombiana ENKI. En la actualidad desarrollamos el Sistema de información molecular y georreferencias de ß-lactamasas BLA.ID.
Damos cursos de formación en Bioinformática para programas postgrado, y periódicamente organizamos cursos de extensión internacionales con la colaboración de instituciones como el Instituto Suizo de Bioinformática, la EMBnet y la Red Iberoamericana de Bioinformática RIBO.

Integrantes

Director/Profesor
Emiliano Barreto Hernández. MSc. cPhD

Profesores/Investigadores
María Teresa Reguero Reza
José Ramón Mantilla Anaya
Emilia María Valenzuela de Silva
John Douglas Linch
Helber Barbosa Barbosa
Fabio Ancízar Aristizábal Gutiérrez.
Laurent Falquet

Estudiante de postgrado
Keile Bruges Pineda

Contacto:
Profesor Asociado Emiliano Barreto Hernández
Director y Colombia EMBnet Node Manager
Ciudad Universitaria - Carrera 30 No. 45-03
IBUN - Instituto de Biotecnología, Bogotá D. C., Colombia
Teléfono: (57-1) 3165000 Ext. 16956
Grupo en CvLAC
Correo electrónico: ebarretoh@unal.edu.co
http://bioinf.ibun.unal.edu.co
http://www.co.embnet.org

Laboratorio de Micología y Fitopatología

LAMFU UNIVERSIDAD DE LOS ANDES

El laboratorio de Micología y Fitopatología de la Universidad de los Andes (LAMFU) fue creado en Noviembre de 2005, con el objetivo primordial de realizar investigación de alta calidad en micología médica y fitopatología y así mismo contribuir al conocimiento científico en estas áreas por medio de publicaciones e investigación en colaboración con otras instituciones.

Actualmente el laboratorio tiene 4 lineas de investigación:

i) Phytophthora

ii) Xanthomonas

iii) Hongos: Micología Médica, Batracochytridium dendrobatidis, Fusarium, etc.

iv) Genómica y bioinformática.

El excelente trabajo realizado en estas líneas de investigación, la calidad de los servicios prestados a diferentes entidades y el destacado equipo de trabajo que incluye personal minuciosamente seleccionado por su interés en la investigación y excelencia académica, ha generado que el laboratorio sea reconocido tanto a nivel nacional como internacional, y sea una apuesta a futuro en el ámbito científico colombiano.

Investigadores Principales

PUBLICACIONES

• Pinzón, A., Rodriguez-R., L.M., González, A., Bernal, A. and S. Restrepo. 2010. Targeted Metabolic Reconstruction: a novel approach for the characterization of plant-pathogen interactions. Briefings in bioinformatics. In press

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